结论：网贷异地起诉能否查到农村信用社存款，取决于多种因素，不能一概而论，以下分情况说明。

1. 法院调查权限与程序
   根据《民事诉讼法》规定，法院有权根据当事人申请或依职权调查取证。若网贷平台作为原告，向法院申请调查令或提供初步证据证明被告在农村信用社有存款，且该存款与案件具有关联性（如涉及还款能力、财产转移等），法院可能通过司法协助程序要求信用社配合查询。但需注意，法院不会随意查询个人存款，必须基于合法诉讼程序和明确调查目的。

2. 异地起诉的特殊性
   异地起诉本身不影响法院调查权限。若被告户籍地或经常居住地与起诉法院不在同一辖区，法院可通过“委托调查”方式，由被告所在地法院协助查询信用社存款。实践中，跨省调查可能因银行系统权限、地方保护等因素存在操作难度，但法律上并不禁止。

3. 信用社的配合义务
   农村信用社作为金融机构，有义务配合司法机关查询、冻结存款。但需提供合法手续，如法院出具的《协助查询存款通知书》《执行裁定书》等。若手续不全或程序违法，信用社有权拒绝。

4. 被告的抗辩空间
   若被告认为查询行为违法（如与案件无关、超出诉讼范围），可向法院提出异议，要求撤销调查令或排除证据。此时，法院需审查查询的合法性与必要性。

建议：

• 若您是被告，收到法院调查通知后，应核实手续合法性，必要时委托律师介入；
  
• 若您是原告，需提前收集被告财产线索（如银行账号、交易记录），提高调查效率；
  
• 无论哪方，均需遵守诉讼程序，避免因程序瑕疵导致证据无效。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件情况。