关于您提出的“员工发放最低工资时，公司罚款扣除是否合法”的问题，这确实是一个涉及劳动法规定和员工权益的重要议题。以下是我对此问题的详细解答：
首先，我们需要明确的是，公司罚款扣除工资的合法性主要取决于其规章制度、扣款原因及扣款方式是否符合法律法规。在员工已经处于发放最低工资的情况下，公司若要进行罚款扣除，必须格外谨慎，并确保所有操作均符合法律要求。
合法情况分析
规章制度明确且合理：
- 如果公司有明确、合法的规章制度，并且这些规章制度已经过民主程序制定（如职工代表大会讨论通过），内容不违反法律法规的强制性规定，且已向员工公示或告知，那么在这些规章制度规定的范围内进行罚款扣除可能是合法的。
- 但即便如此，罚款金额也必须合理。通常，每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地政府所设定的月最低工资标准。在您的情况下，由于员工已经处于发放最低工资的状态，因此任何罚款扣除都必须确保不会使员工的工资低于这一标准。
员工造成经济损失：
- 如果因员工本人原因给公司造成了经济损失，公司有权按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但这种赔偿同样需要遵循上述的扣除限额和最低工资标准。
不合法情况分析
无规章制度或规章制度不合法：
- 如果公司没有合法有效的规章制度作为罚款扣除的依据，或者规章制度本身违法（如违反法律法规、显失公平等），那么公司随意对员工进行罚款扣除就是违法的。
罚款理由不充分、不合理：
- 即使公司有规章制度，但如果罚款理由不充分、不合理（如因轻微过失而进行过重罚款），这种罚款扣除行为也可能被认定为不合法。特别是在员工已经处于发放最低工资的情况下，任何不合理的罚款扣除都可能被视为对员工权益的侵犯。
恶意克扣工资：
- 公司不得以任何无理由或恶意的方式克扣员工工资。如果公司试图通过罚款扣除来恶意降低员工的工资水平，特别是当员工已经处于发放最低工资的状态时，这种行为是严重违法的。
员工权益保护建议
面对不合法的罚款扣除行为，您作为员工可以采取以下措施来维护自己的权益：
与公司协商解决：首先尝试与公司沟通，要求解释罚款扣除的理由和依据，并寻求双方都能接受的解决方案。
向劳动监察部门投诉：如果协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉，请求他们介入调查并处理这种不合法的罚款扣除行为。
申请劳动仲裁：在必要时，您还可以向当地劳动仲裁机构申请仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。
综上所述，在员工发放最低工资的情况下，公司进行罚款扣除必须格外谨慎，并确保所有操作均符合法律法规的要求。如果公司试图通过不合理的罚款扣除来降低员工的工资水平，您作为员工有权采取适当的措施来维护自己的合法权益。