分公司独立核算且若其不具备独立法人资格，则不能独立进行合并，而是需跟随总公司一起进行组织架构调整或合并。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、法律角度
法人资格：
- 根据《中华人民共和国公司法》第十四条，公司可以设立分公司，但分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。这意味着分公司无法独立承担法律责任，所有民事责任均由总公司承担。
- 既然分公司不具备法人资格，那么它也就无法与其他公司或实体进行合并，因为合并通常涉及两个或更多具有法人资格的实体的法律行为。
合并规定：
- 《中华人民共和国公司法》第一百七十二条规定，公司合并可以采取吸收合并或者新设合并。但这里的“公司”指的是具有法人资格的公司，不包括分公司。
- 因此，从法律角度来看，分公司无法独立进行合并，而是需要作为总公司的一部分参与合并过程。
二、财务与税务角度
财务报表合并：
- 尽管分公司独立核算，但根据法律规定和财务准则，总公司在编制财务报表时，需要将独立核算分公司的财务数据纳入合并报表范围。这是因为分公司虽独立核算，但不具有独立法人资格，其经营活动、资产负债等本质上是总公司业务的一部分。
- 合并报表能全面反映企业集团的财务状况，为投资者、债权人提供完整信息。
税务处理：
- 独立核算分公司在流转税上通常就地申报缴纳，但在企业所得税上由总公司汇总计算并缴纳。这涉及税务数据的汇总合并，以确保税收法规的遵守和税款的准确计算。
- 因此，从税务角度来看，分公司也无法独立进行税务合并，而是需要与总公司一起进行税务处理。
三、经营管理角度
战略协同：
- 基于整体战略规划，企业可能希望加强各业务板块间的协同效应，整合资源以提高运营效率。此时，将独立核算分公司进行合并（作为总公司的一部分），有助于统一采购、销售，降低成本，实现规模经济。
- 但这种合并并非分公司独立进行的，而是需要总公司进行统一规划和决策。
管理简化：
- 独立核算分公司若各自为政，可能导致管理成本上升和信息沟通不畅。合并分公司（作为总公司的一部分）可简化管理架构，减少管理层级，提高决策效率。
- 同样，这种管理上的合并也是基于总公司的整体战略和决策。
总结与建议
综上所述，分公司独立核算且不具备独立法人资格时，无法独立进行合并。而是需要作为总公司的一部分，跟随总公司一起进行组织架构调整或合并。企业在考虑是否合并分公司时，应综合考虑战略规划、实际经营状况以及法律法规要求，确保决策的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。