交通事故死亡赔偿协议中关于不追究司机刑事责任的条款是无效的。以下从不同角度为您详细分析：
一、刑事责任与民事赔偿责任的区分
刑事责任：交通肇事罪属于刑事案件，当交通事故造成一人死亡且肇事司机负事故主要或全部责任时，即构成交通肇事罪。刑事责任是国家对犯罪行为的制裁，具有强制性，不能通过私下协议免除。
民事赔偿责任：这是肇事司机对受害人家属因交通事故造成的经济损失所承担的赔偿责任。这部分责任可以通过双方协商，在赔偿协议中明确约定，是双方对私权利的处分，这部分约定通常是有效的。
二、不追究刑事责任条款无效的原因
违反法律强制性规定：是否追究肇事者的刑事责任属于公权力范畴，由国家司法机关依法决定，双方无权私下处分。因此，协议中关于不追究司机刑事责任的条款违反了法律的强制性规定，是无效的。
损害公共利益：刑事责任不仅关乎受害人家属的权益，更关乎社会公共秩序和安全。允许通过私下协议免除刑事责任，将损害公共利益，破坏法治秩序。
三、赔偿协议的其他部分可能有效
尽管不追究刑事责任的条款无效，但赔偿协议中关于民事赔偿责任的部分，如赔偿金额、支付方式等，如果双方自愿、合法地签订，且内容不违反相关法律法规，通常是有效的。这部分约定是双方对私权利的合法处分。
四、达成赔偿协议及取得谅解对量刑的影响
虽然赔偿协议不能免除肇事司机的刑事责任，但达成赔偿协议并取得受害人家属的谅解，对肇事司机的量刑是有帮助的。法院在量刑时，会考虑这一情节，可能对肇事司机从轻处理。
五、建议与注意事项
签订协议前咨询专业律师：在签订交通事故死亡赔偿协议前，建议咨询专业律师，确保协议内容合法、有效，避免后续纠纷。
警惕无效条款：在签订协议时，要警惕那些违反法律强制性规定或损害公共利益的条款，如不追究刑事责任的条款，这些条款是无效的。
保留相关证据：在签订协议和履行过程中，要保留好相关证据，如协议文本、支付凭证等，以备不时之需。
举例说明：假设某起交通事故中，肇事司机与受害人家属签订了赔偿协议，其中约定了赔偿金额和支付方式，并附加了不追究司机刑事责任的条款。后来，肇事司机被法院以交通肇事罪提起公诉。此时，受害人家属不能以协议中的不追究刑事责任条款为由，要求法院免除肇事司机的刑事责任。但受害人家属可以依据协议中的赔偿条款，要求肇事司机履行赔偿义务。
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