在集体土地遇到征收，专家委员会不给鉴定并等待重新做出补偿的情况下，补偿通常由县级以上地方人民政府作出。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据与补偿主体

根据《中华人民共和国土地管理法》及其实施条例的相关规定，国家征收土地的，依照法定程序批准后，由县级以上地方人民政府予以公告并组织实施。这包括拟定征地补偿安置方案、与拟征收土地的所有权人、使用权人就补偿、安置等签订协议，以及在协议不成或未签订协议的情况下，作出征地补偿安置决定等。因此，在集体土地征收过程中，补偿的主体通常是县级以上地方人民政府。

二、专家委员会的角色与鉴定

专家委员会在集体土地征收过程中可能扮演评估或鉴定的角色，但其鉴定结果并非最终决定补偿的唯一依据。如果专家委员会不给鉴定或鉴定结果不被采纳，这并不影响县级以上地方人民政府依法作出补偿决定。政府会根据相关法律法规、政策以及实际情况，综合考虑多种因素来确定补偿标准和方式。

三、重新做出补偿的流程

1. 政府启动重新补偿程序：在专家委员会不给鉴定或鉴定结果不被采纳的情况下，如果认为需要重新做出补偿，县级以上地方人民政府会启动重新补偿程序。
2. 调查与评估：政府会组织相关部门对征收土地进行调查和评估，包括土地面积、用途、地上附着物和青苗的情况等，以确定合理的补偿标准。
3. 拟定补偿方案：根据调查和评估结果，政府会拟定征地补偿安置方案，并予以公告，听取被征收土地的农村集体经济组织和农民的意见。
4. 签订补偿协议或作出补偿决定：政府会与被征收土地的所有权人、使用权人就补偿、安置等签订协议。如果协议不成或未签订协议，政府会依法作出征地补偿安置决定。
5. 实施补偿：最后，政府会按照补偿协议或补偿决定的内容，对被征收土地的所有权人、使用权人进行补偿。

四、特殊情况下的补偿主体

虽然通常情况下补偿由县级以上地方人民政府作出，但在某些特殊情况下，如开发区管理机构等地方政府派出机构在其管理范围内进行土地征收和补偿时，如果其具有行政主体资格，那么它也可能成为补偿的主体。不过，这种情况相对较少，且需要具体分析其行政主体资格和法律授权情况。

五、建议与注意事项

1. 了解相关法律法规：被征收土地的所有权人、使用权人应了解相关法律法规和政策，以便在征收过程中维护自己的合法权益。
2. 积极参与补偿程序：在补偿过程中，应积极参与调查和评估、提出意见和建议、签订补偿协议等环节，确保自己的权益得到充分保障。
3. 寻求法律援助：如果在补偿过程中遇到问题或争议，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以便更好地维护自己的权益。

如果有任何关于集体土地征收补偿的法律问题，可以直接向我咨询。