针对您提出的“侵占军事用地怎么处理”的问题，这是一个涉及国家安全和军事利益的重要议题。根据相关法律法规和实际案例，处理侵占军事用地的情况通常遵循以下步骤和原则：

一、法律基础与原则

首先，需要明确的是，军事用地是受到国家严格保护的特殊用地，任何单位和个人不得非法侵占、破坏或改变其用途。我国《国防法》、《军事设施保护法》等相关法律法规对此有明确规定，并设定了相应的法律责任。

二、处理流程

1. 发现与报告：

   • 当发现军事用地被侵占时，部队或相关管理部门应立即进行调查核实，并向上级军事机关或地方检察机关报告。

2. 调查与取证：

   • 军事机关或地方检察机关会成立专案组，对侵占情况进行详细调查，包括侵占的范围、时间、原因等，并收集相关证据。

3. 协商与磋商：

   • 在调查清楚事实后，军事机关或检察机关可能会邀请相关单位负责人召开公益诉讼磋商会议，就侵占问题的解决进行协商。

4. 制发检察建议或行政命令：

   • 根据磋商结果，军事机关或检察机关会制发检察建议或行政命令，督促相关单位依法整改，包括更正土地权属证件、拆除违法建筑、清空违法占地等。

5. 执行与监督：

   • 相关单位在接到检察建议或行政命令后，应立即执行整改措施。同时，军事机关或检察机关会对整改情况进行监督，确保问题得到彻底解决。

6. 法律追责：

   • 对于拒不执行整改措施或继续侵占军事用地的单位和个人，将依法追究其法律责任，包括行政处罚、刑事责任等。

三、实际案例参考

以您提供的两个案例为例：

• 南昌空军某训练靶场土地被侵占案：军地检察机关通过高质效协作，成功收回了被侵占的训练场土地，并督促相关单位依法整改，包括更正土地权属证件、拆除重叠地块上的构筑物等。

• 贵州省桐梓县某部队军事设施场地被侵占案：桐梓县检察院联合昆明军事检察院等部门，通过行政公益诉讼的方式，成功收回了被侵占的25.35亩军事设施场地，并推动了当地军事设施保护长效机制的建立。

四、建议与措施

• 加强宣传教育：提高公众对军事设施保护的认识和意识，减少因无知或疏忽而导致的侵占行为。

• 完善法律法规：进一步细化军事设施保护的相关法律法规，明确侵占军事用地的法律责任和处罚措施。

• 强化监管力度：军事机关和地方相关部门应加强对军事用地的监管力度，及时发现并处理侵占行为。

综上所述，处理侵占军事用地的情况需要遵循法律法规和原则，通过调查取证、协商磋商、制发检察建议或行政命令、执行与监督以及法律追责等步骤来确保问题得到妥善解决。同时，加强宣传教育、完善法律法规和强化监管力度也是预防和处理侵占军事用地问题的重要措施。