结论前置：若货物仍在司机手上且涉及诉讼，需根据货物权属、运输合同关系及诉讼目的，通过法律程序主张权利。具体处理方式如下：

1. 明确货物权属及合同关系
   首先需确认货物所有权归属（是否属于原告或原告委托运输的货物），并审查运输合同条款（如承运人责任、交付方式、违约条款等）。若司机系承运人，其未按约定交付货物可能构成违约；若司机系无权占有（如盗窃、侵占），则可能涉及侵权责任。

2. 诉讼中申请财产保全
   若担心货物被转移或损毁，可在起诉时向法院申请诉前财产保全或诉中财产保全，要求法院查封、扣押货物。需提供担保（如保险公司保函）并证明情况紧急（如司机有转移财产风险）。保全后，法院将责令司机保管货物或交由第三方保管。

3. 主张违约或侵权责任

   • 违约责任：若司机基于运输合同未履行交付义务，原告可要求其继续履行（交付货物）、赔偿损失（如货物贬值、市场机会损失）或解除合同并返还运费。
     
   • 侵权责任：若司机无合法依据占有货物（如私自变卖），原告可主张返还货物或赔偿等价损失，并可要求惩罚性赔偿（如符合《民法典》侵权编规定）。

4. 执行阶段的处理
   若判决生效后司机仍不交付货物，可申请法院强制执行。执行措施包括：

   • 扣押货物并交付原告；
     
   • 若货物已灭失或无法返还，责令司机赔偿等价款项；
     
   • 对司机采取限制高消费、列入失信名单等信用惩戒措施。

5. 特殊情形处理

   • 货物易腐坏或需紧急处置：可向法院申请先予执行，要求司机立即交付或允许原告变卖货物并提存价款。
     
   • 司机下落不明：需公告送达并缺席判决，执行时可通过查询司机财产线索（如银行账户、车辆）强制执行。

行动建议：

• 立即整理运输合同、货物权属证明（如发票、提单）、司机身份信息等证据；
  
• 委托律师起草起诉状及保全申请书，确保程序合法性；
  
• 同步与司机协商，若其同意交付可签署和解协议并申请法院确认效力。
  

如有进一步细节（如货物类型、合同条款争议点），可直接向我提供信息以便针对性分析。