关于借款人是分公司但加盖总公司章的效力问题，结论需视具体情况而定，并非一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
分公司授权范围内借款并加盖总公司章
- 分公司虽不具备独立法人资格，但通常具备一定的民事行为能力。若分公司在总公司明确授权的范围内进行借款，并加盖了总公司的章，此借款合同一般被视为有效。
- 在此情况下，分公司的行为可视为总公司的代理行为，其产生的法律后果由总公司承担。这意味着，如果分公司未能按时还款，债权人可以要求总公司承担还款责任。
分公司超越授权范围借款并加盖总公司章，且相对人明知
- 如果分公司超越了总公司的授权范围进行借款，并加盖了总公司的章，而债权人（即相对人）在借款时明知分公司超越了权限，那么此借款合同的效力就处于待定状态。
- 在这种情况下，合同的最终效力取决于总公司的态度。如果总公司事后追认该借款行为，那么合同就有效；如果总公司拒绝追认，那么合同对总公司就不产生效力，相应的法律后果（如还款责任）应由分公司自行承担。
分公司超越授权范围借款并加盖总公司章，但相对人不知情
- 如果分公司超越了总公司的授权范围进行借款，并加盖了总公司的章，而债权人（即相对人）在借款时并不知情（即善意相对人），那么根据相关法律规定，该借款合同可能仍然对总公司产生效力。
- 这是因为，善意相对人有理由相信分公司是在总公司的授权范围内进行借款的，因此其合法权益应得到保护。当然，具体情况还需根据相关法律法规和司法实践进行判断。
法律建议：
- 对于总公司而言，应加强对分公司的管理和监督，明确授权范围，避免分公司超越权限进行借款等民事活动。
- 对于债权人而言，在与分公司进行借款等民事活动时，应尽可能了解分公司的授权情况，并要求分公司提供总公司的明确授权文件或证明。
- 如果发生纠纷，建议及时咨询专业律师，通过法律途径维护自己的合法权益。
可能法律后果：
- 如果借款合同有效，那么借款人（无论是分公司还是总公司）应按照合同约定履行还款义务。
- 如果借款合同无效或效力待定，那么可能涉及还款责任的重新分配或合同撤销等问题。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您还有其他法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。