针对您提出的“占用永久基本农田发展林果业，违法面积如何计算”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国土地管理法》第三十七条第三款的规定，禁止占用永久基本农田发展林果业和挖塘养鱼。这是为了保护耕地资源，确保粮食生产安全而制定的法律条款。

关于违法面积的计算，这通常涉及到对实际占用永久基本农田进行林果业种植的土地面积的测量。在实际操作中，这一般由县级以上人民政府自然资源主管部门负责进行。他们会通过专业的测绘手段，如使用GPS定位仪、全站仪等设备，对违法占用的土地进行精确测量，从而确定违法面积。

进一步地，根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》第五十一条的规定，非法占用永久基本农田发展林果业的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令限期改正；逾期不改正的，按占用面积处耕地开垦费2倍以上5倍以下的罚款。这里的“占用面积”即指违法占用的永久基本农田面积，是计算罚款的重要依据。

此外，如果占用永久基本农田发展林果业的行为破坏了耕地的种植条件，那么还将依照《中华人民共和国土地管理法》第七十五条的规定进行处罚。这通常涉及到对耕地种植条件的评估，以及根据评估结果确定的相应处罚措施。

在实际操作中，为了确保违法面积计算的准确性和公正性，县级以上人民政府自然资源主管部门会遵循严格的测绘和评估程序。同时，他们也会根据当地的实际情况和耕地开垦费的标准，合理确定罚款的数额。

综上所述，占用永久基本农田发展林果业的违法面积是通过专业测绘手段进行精确测量的，并作为计算罚款的重要依据。如果您或他人存在此类违法行为，建议尽快采取恢复耕种措施，以避免可能的法律责任。