当法院判决的房产已被抵押时，这确实是一个涉及多方利益的复杂法律问题。不过，无论房产是否抵押，法院的判决都是具有法律效力的，必须得到履行。接下来，我将从不同主体的角度出发，为您详细梳理并解释相关法律知识点及应对措施。
对于申请执行判决的一方：
核实抵押情况：
- 您需要首先确认抵押的真实性和合法性。这包括审查抵押合同、他项权证等文件，以及抵押的设立时间和程序。如果发现抵押存在恶意逃避执行的情况，您可以向法院提起诉讼，请求确认抵押行为无效。
参与分配拍卖款：
- 如果抵押是合法有效的，并且法院需要强制执行该房产，您可以申请参与分配拍卖房产所得款项。但需要注意的是，抵押权人享有优先受偿权，剩余款项才会用于执行判决确定的债权。
提出执行异议之诉：
- 如果您认为抵押行为影响了您的合法权益，可以通过执行异议之诉来维护自身权益。这需要您证明抵押行为存在违法或不合理之处。
考虑其他财产执行：
- 如果房产执行存在困难，而债务人有其他财产，您可以向法院申请先执行其他财产以满足判决要求。
对于抵押人（通常是原房产所有人）：
积极履行判决义务：
- 您应尽快履行判决确定的义务，如偿还债务、交付房产等。您可以与申请执行人协商解决方案，如分期偿还债务，以避免房产被强制执行。
与贷款机构沟通：
- 您应与贷款机构联系，尝试通过协商找到双方都能接受的解决办法，如提前还款解除抵押，或延缓执行以争取处理时间。
与抵押权人协商：
- 向抵押权人说明房产已被判决的情况，尝试达成解决方案，如提前偿还部分或全部抵押债务，解除抵押登记。
对于抵押权人：
关注法院执行程序：
- 您应及时了解法院对抵押房产的执行情况，并向法院申报抵押权，以确保您的优先受偿权得到保障。
配合法院执行：
- 在法院对抵押房产进行拍卖等执行措施时，您应配合提供相关文件和债权证明，以便法院准确确定拍卖款的分配顺序。
参与协商与和解：
- 您可以积极参与与抵押人、申请执行人的协商过程，寻求和解方案，以最大化保障自身权益。
综合建议：
- 在处理此类复杂法律问题时，我建议您咨询专业律师以获取具体、可行的法律建议。
- 各方应保持沟通，通过协商、法律程序等途径共同寻求最佳解决方案，以确保各方权益得到妥善处理。
- 法院在执行过程中也应充分考虑各方利益，依法公正、公平地执行判决。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。