股东在特定情形下确实可以申请公司清算。这一结论基于《中华人民共和国公司法》及其相关司法解释的规定，旨在保障股东在特定情况下的合法权益，并确保公司清算过程的合法性和公正性。以下是对这一问题的详细分析：
一、股东申请清算的法定情形
公司经营管理发生严重困难：
- 当公司持续两年以上无法召开股东会或股东大会，导致经营管理严重困难时；
- 股东表决无法达到法定或公司章程规定的比例，持续两年以上不能做出有效决议，影响公司正常运营时；
- 公司董事长期冲突，无法通过股东会或股东大会解决，导致公司经营管理陷入僵局时；
- 以及其他经营管理严重困难，公司继续存续会使股东利益受到重大损失的情形。
- 申请条件：单独或合计持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东，有权向人民法院提起解散公司诉讼，并申请清算。
公司解散后逾期不成立清算组：
- 当公司出现解散事由（如营业期限届满、股东会决议解散、被吊销营业执照等）后，未在规定时间内成立清算组进行清算时；
- 申请条件：债权人或股东（持有一定比例表决权）可向人民法院申请指定有关人员组成清算组进行清算。
清算组故意拖延清算或违法清算：
- 若清算组成立后不积极开展清算工作，故意拖延，导致公司资产贬值、流失等，损害股东利益时；
- 若清算组在清算过程中存在违法行为，如隐匿财产、对资产负债表或财产清单作虚假记载等，可能严重损害债权人或股东利益时；
- 申请条件：股东有权向法院申请强制清算，以维护自身及公司的合法权益。
二、股东申请清算的法律程序
- 准备申请材料：股东需准备相关证据材料，如公司章程、股东会决议、公司经营管理困难的相关证明等，以证明其申请清算的合法性和必要性。
- 向人民法院提起申请：股东应向有管辖权的人民法院提交清算申请，并附上相关证据材料。
- 法院审查与受理：人民法院将对股东的申请进行审查，符合法定条件的，将予以受理，并指定清算组进行清算。
- 清算组进行清算：清算组将依法对公司进行清算，包括清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、通知债权人、处理公司债权债务等。
- 清算结束与注销登记：清算结束后，清算组将制作清算报告，并报人民法院确认。经确认后，公司可向公司登记机关申请注销登记。
三、股东申请清算的注意事项
- 确保申请条件符合法律规定：股东在申请清算前，应仔细审查自身是否满足法定申请条件，以避免因条件不符而导致申请被驳回。
- 准备充分的证据材料：股东应准备充分的证据材料来支持其申请，如公司经营管理困难的相关证明、清算组违法违规的证据等。
- 遵守法律程序：股东在申请清算过程中，应严格遵守法律程序，如按时提交申请材料、参加法院组织的听证会等。
- 关注清算进展与结果：股东应密切关注清算进展与结果，确保清算过程合法、公正进行，并维护自身及公司的合法权益。
举例说明：假设某公司因董事长期冲突无法形成有效决议，导致公司经营管理陷入僵局。此时，持有公司全部股东表决权百分之十二的股东A认为公司继续存续将使其利益受到重大损失，且无法通过其他途径解决。在此情况下，股东A有权向人民法院提起解散公司诉讼，并申请清算。经法院审查并受理后，将指定清算组对公司进行清算，以维护股东A及其他股东的合法权益。
综上所述，股东在特定情形下可以申请公司清算。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。