结论：宠物保险等待期结束后去手术，一般不会因等待期问题被拒赔，但可能因其他原因被拒赔，以下分情况说明：

1. 符合保险条款约定的情况
   • 如果宠物所患疾病或遭受的意外属于保险合同约定的保障范围，且手术是针对该疾病或意外进行的合理、必要治疗，同时不存在其他免责情形，那么在等待期结束后进行手术，保险公司应当按照合同约定进行赔付。例如，宠物在等待期后确诊患有合同约定的某种疾病，需要进行手术治疗，且该手术是常规的、被广泛认可的治疗方式，这种情况下保险公司不会拒赔。
2. 存在免责情形的情况
   • 既往症：如果宠物在投保前已经患有某种疾病，即使等待期结束后因该疾病进行手术，保险公司也可能拒赔。因为既往症通常不在保险保障范围内，这是为了防止投保人带病投保，增加保险公司的风险。比如，宠物在投保前就有心脏方面的疾病，等待期后因该心脏疾病恶化需要手术，保险公司可能会以既往症为由拒绝赔付。
   • 未如实告知：在投保时，投保人有义务如实告知宠物的健康状况等信息。如果投保人故意或因重大过失未履行如实告知义务，足以影响保险公司决定是否同意承保或者提高保险费率的，保险公司有权解除合同，并对合同解除前发生的保险事故不承担赔偿或者给付保险金的责任。例如，投保人明知宠物有某种慢性疾病，但在投保时未告知保险公司，等待期后宠物因该疾病手术，保险公司发现后可能会拒赔。
   • 非合同约定原因：如果手术并非是因为保险合同约定的疾病或意外导致，而是其他原因，如宠物主人自行决定为宠物进行的美容手术、非必要的预防性手术等，保险公司不会赔付。比如，宠物主人觉得宠物的牙齿不太整齐，自行带宠物去做牙齿矫正手术，这种手术不属于保险合同约定的保障范围，保险公司会拒赔。
3. 未按照合同要求操作的情况
   • 未在指定医疗机构治疗：有些宠物保险合同会约定指定的医疗机构，如果宠物主人未在指定医疗机构为宠物进行手术，保险公司可能会拒赔。这是因为指定医疗机构通常经过保险公司的审核，能够保证治疗的质量和费用的合理性。例如，合同约定必须在某几家指定的宠物医院进行手术，但宠物主人却选择了一家非指定的医院，保险公司可能会以此为由拒绝赔付。
   • 未及时通知保险公司：在宠物发生保险事故后，投保人应及时通知保险公司。如果未及时通知，导致保险事故的性质、原因、损失程度等难以确定的，保险公司对无法确定的部分，不承担赔偿或者给付保险金的责任。比如，宠物在等待期后受伤需要手术，但宠物主人过了很长时间才通知保险公司，此时一些关键证据可能已经丢失，保险公司可能会对部分损失拒赔。

如果遇到宠物保险拒赔的情况，你可以先与保险公司沟通，了解拒赔的具体原因。如果对保险公司的拒赔决定有异议，可以通过法律途径维护自己的合法权益。有问题可以直接向我咨询。