针对您提出的“农业农村部门土地仲裁后如何处理土地纠纷”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

在农业农村部门进行土地仲裁后，处理土地纠纷的流程主要遵循以下几个步骤：

一、仲裁裁决的履行

首先，当事人应当按照仲裁裁决的内容履行各自的义务。这是仲裁制度的基本要求，也是维护仲裁权威性和有效性的重要保障。仲裁裁决具有法律效力，对双方当事人均有约束力，因此，当事人必须认真对待并履行裁决。

二、不履行裁决的处理

若一方当事人不履行仲裁裁决，另一方当事人有权向人民法院申请强制执行。这是法律赋予当事人的权利，也是确保仲裁裁决得到有效执行的重要手段。在申请强制执行时，当事人需要提供相关的仲裁裁决书和执行申请书等材料。

三、对裁决有异议的处理

在履行裁决过程中，如果双方对裁决内容有异议或发现裁决存在错误，可以通过合法途径寻求救济。例如，当事人可以申请撤销仲裁裁决，但这一申请必须符合法定条件，如仲裁程序违法、裁决所依据的证据是伪造的等。在申请撤销仲裁裁决时，当事人需要向有管辖权的人民法院提出，并提供相关证据材料。

四、后续纠纷的协商解决

除了通过法律途径解决纠纷外，当事人也可以在仲裁裁决生效后，通过协商等方式解决后续的纠纷问题。这种方式更加灵活、高效，可以避免不必要的诉讼成本和时间消耗。在协商过程中，双方可以就裁决内容的具体执行、后续合作等事宜进行友好沟通，寻求共识和解决方案。

五、农业农村部门的角色

在整个处理过程中，农业农村部门（如农村土地承包仲裁委员会）扮演着重要角色。他们不仅负责仲裁程序的组织和实施，还负责监督裁决的执行情况，并提供必要的法律指导和帮助。同时，农业农村部门也会根据实际情况，采取差异化、区别性的措施，用群众接受的办法解决问题，维护当事人的合法权益和社会稳定。

综上所述，农业农村部门土地仲裁后处理土地纠纷的流程主要包括仲裁裁决的履行、不履行裁决的处理、对裁决有异议的处理、后续纠纷的协商解决以及农业农村部门的角色等方面。希望这些解答能够帮助您更好地理解和处理土地纠纷问题。