结论：挂靠资质开分公司并设立独立账户的行为，在法律层面存在重大风险且通常不被允许，具体分析如下：

1. 挂靠资质的法律定性
   根据《建筑法》第六十六条及《民法典》第七百九十一条，挂靠行为（即无资质单位或个人借用有资质企业名义承揽工程）属于违法行为。被挂靠企业允许他人挂靠，需承担连带赔偿责任，甚至可能面临行政处罚（如停业整顿、降低资质等级、吊销资质证书等）。若分公司以挂靠方式设立，其法律责任将直接溯及被挂靠的总公司。

2. 独立账户的合规性风险
   分公司虽可设立独立账户，但需满足两个前提：

   • 合法设立：分公司必须依法登记并取得营业执照，其经营范围不得超出总公司资质范围；
     
   • 资金合规：账户资金流动需符合财务制度，若用于挂靠项目，可能被认定为“资金走账”行为，涉嫌协助逃避监管，构成共同违法。
     实践中，挂靠方通过独立账户操作资金，极易被认定为“以合法形式掩盖非法目的”，导致账户被冻结、合同无效等后果。

3. 实务操作中的连带责任
   即使分公司独立核算，若发生工程质量、安全事故或债务纠纷，根据《公司法》第十四条，总公司仍需对分公司债务承担补充责任。挂靠关系下，被挂靠企业可能因“出借资质”被认定为实际施工人，需对全部债务负责，独立账户无法隔离风险。

建议：

• 若需拓展业务，应通过合法途径设立分公司，并确保分公司资质与总公司一致；
  
• 避免任何形式的资质挂靠，可通过联合体投标、项目合作等合规方式开展业务；
  
• 已存在挂靠行为的，建议立即终止并梳理法律风险，必要时向行政主管部门备案说明。
  

如有具体案例或合同文本需审查，可直接向我提供细节进一步分析。