国有企业破产后，商业用房的所有权归属需根据具体情况来确定。以下是对此问题的详细分析：
一、房屋设定抵押的情况
若商业用房已作为抵押物设定了抵押，那么在破产程序中，该房屋将优先用于清偿抵押权人的债务。这是基于物权法中关于抵押权优先受偿的原则。在清偿完毕后，如有剩余财产，可按照相关法律规定进行分配。这种情况下，房屋的所有权在清偿抵押权人债务前，实际上处于一种受限状态，其最终归属取决于清偿后的剩余情况。
二、房屋未设定抵押的情况
纳入破产财产：若商业用房未设定抵押，在破产清算过程中，通常会将其纳入破产财产。这意味着房屋的所有权暂时归属于破产企业，但实质上是为了进行清算和分配而设定的法律状态。
清偿顺序：按照法定的清偿顺序，破产财产首先用于支付破产费用、职工工资和社会保险费用等。这些费用是破产程序中必须优先清偿的，以确保破产程序的顺利进行和职工权益的保护。
其他债权人清偿：在支付完上述费用后，破产财产将用于对其他债权人进行清偿。这包括但不限于供应商、债权人等。清偿的顺序和比例通常根据破产法的规定和债权人的债权性质来确定。
剩余房屋处置：在清偿完毕后，若还有剩余房屋，可能会根据相关规定和程序进行处置，如拍卖、变卖等。所得价款将用于清偿剩余债务或进行其他合法用途，如纳入企业剩余财产分配给股东（在国有企业破产且无股东或股东为国家的情况下，可能涉及上缴国库等程序）。
三、特殊情况考虑
政策性破产：对于政策性破产的国有企业，可能享有特殊的政策优惠或处理方式。这些政策可能涉及房屋的归属、处置或补偿等方面，因此需要具体了解相关政策规定。
法律程序：在整个破产过程中，必须严格遵守法律程序，包括破产申请的受理、破产财产的清算和分配等。任何违反法律程序的行为都可能导致房屋归属的争议或法律风险。
建议：
在处理国有企业破产后商业用房的所有权归属问题时，建议首先查阅相关的破产法规定和政策文件，以了解具体的法律要求和政策导向。
如有必要，可以寻求专业律师的帮助，以确保在处理过程中遵守法律程序并维护自身权益。
对于涉及复杂法律关系或大量财产的破产案件，建议进行详细的法律尽职调查，以全面了解房屋的所有权状况、抵押情况和其他相关法律问题。