针对您提出的“司机因自身疾病去世，保险公司该怎么赔偿”的问题，这确实是一个涉及多方面因素的复杂情况。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，司机因自身疾病去世与因交通事故导致的死亡在保险赔偿上有显著的区别。在因自身疾病去世的情况下，通常不涉及对第三方（如其他车辆、行人等）的赔偿，而是主要关注司机本人或其家属能否从保险公司获得相应的保险金。

一、保险类型与赔偿

1. 交强险：交强险主要是为交通事故中的第三方提供保障，因此，在司机因自身疾病去世的情况下，交强险通常不会提供赔偿。

2. 商业险：

   • 寿险或意外险：如果司机购买了寿险或包含疾病身故责任的意外险，那么在其因疾病去世时，保险公司应按照合同约定支付相应的保险金。
   • 健康险：如果司机购买了健康险，特别是包含疾病身故保障的健康险，那么在其因疾病去世时，同样可以获得保险公司的赔偿。
   • 车险中的车上人员责任险：这种保险主要是为车上乘客提供保障，对于司机本人因疾病去世的情况，通常不在其保障范围内。但需注意，如果保险合同中有特别约定，则需按约定执行。

二、赔偿流程与注意事项

1. 报案与提交材料：司机家属在得知司机去世后，应及时向保险公司报案，并按照保险公司的要求提交相关的证明材料，如死亡证明、保险合同、身份证明等。

2. 审核与赔付：保险公司会对提交的材料进行审核，确认是否符合保险合同的赔偿条件。一旦审核通过，保险公司将按照合同约定的金额和方式进行赔付。

3. 注意免责条款：在签订保险合同时，应仔细阅读免责条款，了解哪些情况下保险公司不承担赔偿责任。例如，某些保险合同可能规定，因特定疾病（如先天性疾病、遗传性疾病等）导致的身故不在赔偿范围内。

三、其他可能的赔偿来源

除了保险公司外，司机家属还可以考虑以下可能的赔偿来源：

• 单位或雇主：如果司机是在执行工作任务过程中因疾病去世，且单位或雇主存在过错（如未提供必要的健康检查、未合理安排工作等），那么单位或雇主可能需要承担一定的赔偿责任。
• 社会救助或福利：根据当地的社会救助政策或福利制度，司机家属可能有机会获得一定的经济援助。

综上所述，司机因自身疾病去世时，保险公司的赔偿主要取决于司机所购买的保险类型以及保险合同的约定。因此，在处理此类问题时，建议司机家属首先查阅保险合同，了解具体的赔偿条件和流程，并及时与保险公司沟通。如有需要，还可以咨询专业的法律人士或保险顾问以获取更详细的指导和帮助。