结论：破产清算回来的工程款可以由管理人委托支付，但需遵循法定程序和权限。以下是具体分析：

1. 管理人的法定权限

根据《企业破产法》第二十五条，管理人负责管理和处分债务人财产，包括“接管债务人的财产、印章和账簿、文书等资料”“调查债务人财产状况，制作财产状况报告”“决定债务人的内部管理事务”等。工程款作为债务人财产的一部分，管理人有权依法处置，包括委托支付。

2. 委托支付的合法性

管理人委托支付工程款需满足以下条件：

• 程序合法：需通过债权人会议或法院许可（如涉及重大财产处分）。根据《企业破产法》第六十九条，管理人实施对债权人利益有重大影响的财产处分行为（如放弃债权、转让财产等），应当及时报告债权人委员会；未设立债权人委员会的，应报告人民法院。
  
• 目的正当：委托支付需服务于破产清算程序，例如支付破产费用、共益债务或按清偿顺序分配给债权人。
  
• 合同相对性：若工程款涉及与第三方（如承包方）的合同关系，管理人需依据合同约定或法律规定履行支付义务，委托支付不得损害第三方合法权益。

3. 实务操作要点

• 书面委托：管理人应出具书面委托文件，明确支付对象、金额、用途及法律责任。
  
• 资金监管：委托支付的工程款需从债务人账户划转，确保资金流向透明，避免挪用。
  
• 债权人监督：债权人会议或债权人委员会可对委托支付行为提出异议，管理人需作出合理解释。

4. 风险提示

若管理人未经合法程序擅自委托支付，可能面临以下法律后果：

• 被撤销风险：债权人可依据《企业破产法》第三十二条申请撤销管理人的个别清偿行为。
  
• 赔偿责任：管理人因故意或重大过失造成债务人财产损失的，需依法承担赔偿责任（《企业破产法》第一百三十条）。
  

建议：若您是债权人或相关方，可要求管理人提供委托支付的法律依据、程序文件及资金流向说明；若发现违规行为，可向法院或债权人委员会提出异议。如有具体案件细节，欢迎进一步咨询。