签了解除协议并不意味着就完全认了合同中的5000元违约金，具体情况需根据解除协议的内容和双方协商的结果来确定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、解除协议的法律效力

1. 协议内容决定效力：解除协议是双方就合同解除及后续事宜达成的合意。如果解除协议中明确约定了违约金的支付、调整或免除等条款，那么这些条款将具有法律效力，双方应按照协议内容履行。

2. 协议未约定时的处理：如果解除协议中未对违约金作出明确约定，那么原合同中的违约金条款可能仍然有效。但此时，双方可以通过协商来调整违约金的数额或支付方式。如果协商不成，可能需要根据法律规定或原合同条款来确定违约金的支付。

二、违约金的调整与免除

1. 协商调整：在签订解除协议时，双方可以就违约金的数额进行协商。如果一方认为原合同中的违约金过高或过低，可以提出调整请求。经双方协商一致后，可以在解除协议中明确新的违约金数额或支付方式。

2. 法定调整：根据《民法典》等相关法律规定，如果约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。反之，如果违约金过低，不足以弥补损失的，也可以请求增加。但这一调整通常需要在诉讼或仲裁过程中进行。

3. 免除违约金：在特定情况下，如因不可抗力导致合同无法履行、双方协商一致免除违约金等，违约金可能被免除。这需要在解除协议中明确约定。

三、实际操作建议

1. 仔细审查解除协议：在签订解除协议前，务必仔细审查协议内容，特别是关于违约金的条款。确保协议内容符合双方的真实意愿和法律规定。

2. 保留相关证据：在协商和签订解除协议过程中，保留好相关证据，如邮件、短信、录音等。这些证据可能在后续争议解决中起到关键作用。

3. 寻求法律帮助：如果对解除协议的内容或违约金的支付有疑问，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见和帮助。

举例说明：假设你与对方签订了一份合同，约定违约金为5000元。后因某些原因，双方决定解除合同并签订了解除协议。在解除协议中，你们可以约定：

• 完全免除违约金；
• 调整违约金数额为3000元；
• 保持原违约金数额不变，但分期支付等。

无论选择哪种方式，都需要在解除协议中明确约定，并确保双方对协议内容无异议。

如果有任何关于合同纠纷或解除协议的法律问题，可以直接向我咨询。