针对您提出的“非法倒卖农用地由谁处罚”的问题，以下是我的详细解答：
结论前置：非法倒卖农用地的行为将面临行政处罚和刑事处罚的双重制裁，具体由县级以上人民政府自然资源主管部门和司法机关（如法院）负责执行。
一、行政处罚
处罚主体：根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，县级以上人民政府自然资源主管部门是负责查处非法倒卖农用地行为的主要行政机关。
处罚措施：
- 没收违法所得：自然资源主管部门将没收违法者通过非法倒卖农用地所获得的全部收入。
- 罚款：可以并处罚款，罚款额通常为违法所得的10%至50%，具体比例根据违法情节的严重程度确定。
- 责令限期改正：要求违法者在规定期限内纠正其非法行为，如恢复土地原状等。
- 拆除新建建筑物和设施：对违反土地利用总体规划擅自改变土地用途的，将限期拆除在非法转让的土地上新建的建筑物和其他设施。
- 行政处分：对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予行政处分。
二、刑事处罚
处罚主体：当非法倒卖农用地的行为达到刑事犯罪的程度时，将由司法机关（如法院）负责审判和处罚。
处罚措施：
- 非法转让、倒卖土地使用权罪：根据《中华人民共和国刑法》第二百二十八条的规定，以牟利为目的，违反土地管理法规，非法转让、倒卖土地使用权，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处非法转让、倒卖土地使用权价额百分之五以上百分之二十以下罚金；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处非法转让、倒卖土地使用权价额百分之五以上百分之二十以下罚金。
- 情节认定标准：
- 情节严重：包括非法转让、倒卖基本农田五亩以上；非法转让、倒卖基本农田以外的耕地十亩以上；非法转让、倒卖其他土地二十亩以上；非法获利五十万元以上；或其他恶劣情节。
- 情节特别严重：包括非法转让、倒卖基本农田十亩以上；非法转让、倒卖基本农田以外的耕地二十亩以上；非法转让、倒卖其他土地四十亩以上；非法获利一百万元以上；或其他特别严重情节。
三、实际操作中的考量因素
- 违法情节的严重程度：具体处罚标准会根据违法情节的严重程度确定，包括但不限于非法转让土地的所得额、擅自改变土地用途的面积等。这些因素直接影响处罚的轻重。
- 被告人的犯罪动机、手段、造成的后果以及认罪态度：在司法实践中，法院会综合考虑这些因素来确定具体的刑罚。
四、建议与提醒
- 严格遵守土地管理法规：非法倒卖农用地是严重的违法行为，不仅面临行政处罚，还可能触犯刑法，承担刑事责任。因此，强烈建议遵守国家土地管理法规，远离任何形式的非法土地交易行为。
- 及时咨询专业律师：如果您或您身边的人涉及非法倒卖农用地的行为，建议及时咨询专业律师，了解具体的法律后果和应对策略。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。