委托全资子公司进行研发的费用，原则上应由委托方（即母公司）承担，但具体承担方式可能因合同约定、公司内部财务政策及税务处理等因素而有所不同。以下从不同角度进行详细分析：

一、合同约定角度

1. 合同明确约定：如果母公司与全资子公司之间签订了明确的研发合同，并且合同中规定了研发费用的承担方，那么应按照合同约定执行。这是最直接、最明确的费用承担方式。

2. 合同未明确约定：如果合同中没有明确约定研发费用的承担方，那么通常需要根据行业惯例、交易习惯或双方协商来确定。在这种情况下，母公司作为委托方，往往会被视为研发费用的主要承担者。

二、公司内部财务政策角度

1. 母公司财务政策：母公司可能根据其自身的财务政策和战略规划，决定是否承担全资子公司的研发费用。例如，母公司可能为了支持子公司的技术创新和发展，而主动承担部分或全部研发费用。

2. 子公司财务政策：虽然子公司是独立的法人实体，但其财务政策往往受到母公司的控制和影响。因此，子公司在处理研发费用时，也需要考虑母公司的意见和财务政策。

三、税务处理角度

1. 税务合规性：在处理研发费用时，母公司和子公司都需要考虑税务合规性问题。例如，研发费用的加计扣除、税收优惠等政策都可能影响费用的承担方式。

2. 税务筹划：为了降低税负，母公司和子公司可能会进行税务筹划，合理分配研发费用。例如，通过调整费用承担方式，使得母公司或子公司能够享受更多的税收优惠。

四、实际操作建议

1. 明确合同条款：为了避免后续纠纷，母公司和全资子公司在签订研发合同时，应明确约定研发费用的承担方、支付方式、支付时间等条款。

2. 遵循公司内部财务政策：在处理研发费用时，母公司和子公司应遵循各自的财务政策，并确保政策的合规性和一致性。

3. 考虑税务因素：在处理研发费用时，母公司和子公司应充分考虑税务因素，合理进行税务筹划，以降低税负。

4. 保持沟通与协商：在处理研发费用过程中，母公司和子公司应保持密切的沟通与协商，及时解决可能出现的问题和纠纷。