一般情况下，男孩16周岁和女孩16周岁同居并不直接构成违法，但需根据具体情况进行细致分析。以下是对此问题的全面阐述：
一、双方自愿且不涉及其他违法情形时，一般不构成违法
- 法律依据与解释：根据我国法律规定，年满16周岁的未成年人，已具备一定的认知和判断能力，能够对自己的行为和决定负责。因此，在双方完全自愿的基础上建立同居关系，且未出现违背公序良俗、强迫、诱骗等违法情形时，该行为通常不被认定为违法。但需要注意的是，虽然不违法，但这种同居关系并不受法律保护，因为双方均未达到法定婚龄（女性20周岁，男性22周岁），无法形成合法的婚姻关系。
- 实例说明：例如，小明和小红均为年满16周岁的学生，两人在恋爱过程中自愿选择同居，且双方家庭对此均表示知情且无异议。在此情况下，他们的同居行为虽然不违法，但也不受法律保护。
二、存在特殊情形时，可能构成违法或犯罪
违背妇女意志的强奸行为
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，以暴力、胁迫或其他手段强奸妇女的，将受到法律的严惩。
- 实例说明：若小刚与16周岁的小花同居后，经常在小花明确表示拒绝的情况下，使用暴力手段强行与其发生性关系，则小刚的行为构成强奸罪，将受到法律的制裁。
明知对方是被拐卖、绑架的妇女而同居
- 法律依据：同样根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，明知是犯罪的人而为其提供隐藏处所、财物，帮助其逃匿或作假证明包庇的，也将受到法律的惩罚。
- 实例说明：若小李明知16周岁的小莉是被拐卖的妇女，却仍然与其同居并协助其躲避公安机关的解救，那么小李的行为将构成窝藏、包庇罪，同样会受到法律的制裁。
三、关于婚姻效力的特别提示
- 与未满法定婚龄的女孩结婚或同居，均属于无效婚姻或不受法律保护的关系。双方应妥善处理好彼此关系，并遵守相关法律法规和社会道德规范。在达到法定婚龄之前，建议双方保持适当的距离和关系，以避免不必要的法律风险和道德争议。
四、总结与建议
在处理与他人的感情和同居关系时，务必遵循自愿、平等、尊重和合法的原则。任何行为都应建立在双方完全自愿的基础上，并严格遵守社会道德和法律法规。同时，应尊重他人的权利和尊严，共同维护社会的和谐与稳定。如遇具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。