结论前置：在处理弟兄两争去世父母耕地，且其中一方和父母不是一个承包户的情况时，司法部门通常会依据相关法律法规，结合家庭实际情况、承包合同内容以及当地政策规定来进行分配。具体分配方式可能因情况而异，以下是从不同角度进行的分析。
一、法律法规依据
《农村土地承包法》相关规定：
- 根据《农村土地承包法》，农村土地承包经营权可以依法继承，但继承的范围和方式需遵循法律规定。若父母去世后，其承包的耕地仍在承包期内，且未出现法定收回情形（如承包地被依法征收、占用等），则子女有权继承承包经营权。
- 若子女中有人与父母不属于同一承包户，这并不影响其继承权，但继承后可能涉及承包户的调整或重新确认。
《民法典》中关于继承的规定：
- 《民法典》规定了继承的基本原则和顺序，子女作为第一顺序继承人，有权继承父母的遗产，包括承包经营权等财产性权益。
- 在继承过程中，应遵循平等、自愿、协商的原则，尽量通过家庭内部协商解决争议。
二、司法部门可能的分配方式
协商分配：
- 司法部门在处理此类纠纷时，通常会鼓励双方通过协商达成分配协议。协商过程中，可以考虑双方的实际需求、对耕地的贡献程度、未来规划等因素。
- 若协商成功，双方可以签订书面协议，明确各自的权利和义务，避免后续纠纷。
依法判决：
- 若协商无果，司法部门将依据相关法律法规和事实证据进行判决。判决时，会综合考虑承包合同的约定、当地政策规定、家庭实际情况等因素。
- 判决结果可能包括：确认各方对耕地的承包经营权比例、划分具体的耕地范围、确定继承后的承包户调整方案等。
三、特殊情况下的处理
承包户调整：
- 若其中一方与父母不属于同一承包户，且继承后需要调整承包户，司法部门可能会要求双方按照当地政策规定办理承包户调整手续。
- 调整过程中，需确保调整方案的合法性和合理性，避免损害其他家庭成员的合法权益。
政策限制：
- 某些地区可能对农村土地承包经营权的继承和转让有特殊政策限制。司法部门在处理纠纷时，会充分考虑这些政策限制，确保判决结果符合当地政策要求。
四、建议与注意事项
保留证据：
- 双方应妥善保管与耕地承包、继承相关的证据材料，如承包合同、继承公证书、家庭会议记录等。这些证据材料在协商和诉讼过程中将起到关键作用。
寻求专业帮助：
- 若双方对法律法规和政策规定不熟悉，或争议较大难以协商解决，建议寻求专业律师或法律服务机构的帮助。他们可以提供专业的法律意见和诉讼代理服务，帮助双方更好地维护自身权益。
尊重家庭和谐：
- 在处理此类纠纷时，双方应尊重家庭和谐原则，尽量通过协商和妥协解决争议。避免因纠纷升级而破坏家庭关系和社会稳定。
最后，每个家庭的具体情况可能有所不同，司法部门在处理时会根据实际情况进行灵活调整。若您或您的家人遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。