轻伤二级因果关系鉴定机构一般由司法机关指定安排。具体分析如下：

一、鉴定机构的指定主体

在涉及轻伤二级的因果关系鉴定中，鉴定机构通常由司法机关（如公安机关）指定。这是基于法律的规定和程序的要求，以确保鉴定的公正性、客观性和权威性。公安机关在受理伤害案件后，会在一定时间内（如24小时内）开具伤情鉴定委托书，并告知被害人到指定的鉴定机构进行伤情鉴定。

二、鉴定机构的资质与要求

指定的鉴定机构必须具备相应的资质和条件，包括但不限于：

1. 专业资质：鉴定机构应具备进行伤情鉴定的专业资质和认证，确保其具备进行相关鉴定的技术能力和水平。
2. 独立性与公正性：鉴定机构应独立于案件双方，确保鉴定过程的公正性和客观性，避免任何形式的偏见或利益冲突。
3. 专业人员：鉴定机构应拥有专业的鉴定人员，他们应具备丰富的专业知识和实践经验，能够准确、科学地进行伤情鉴定。

三、鉴定程序与时间要求

1. 鉴定委托：公安机关在受理伤害案件后，会开具伤情鉴定委托书，并告知被害人到指定的鉴定机构进行鉴定。
2. 即时鉴定：对于具备即时进行伤情鉴定条件的案件，公安机关的鉴定机构应在受委托之时起24小时内提出鉴定意见，并在3日内出具鉴定文书。
3. 复杂伤情鉴定：对于伤情比较复杂，不具备即时进行鉴定条件的案件，应在受委托之日起7日内提出鉴定意见并出具鉴定文书。
4. 特殊伤情鉴定：对于影响组织、器官功能或者伤情复杂，一时难以进行鉴定的案件，应待伤情稳定后及时提出鉴定意见，并出具鉴定文书。

四、法律后果与责任

如果鉴定机构在鉴定过程中存在违法行为或不当行为，如伪造鉴定结果、泄露鉴定信息等，将承担相应的法律责任。同时，如果被害人对鉴定结果有异议，可以依法申请重新鉴定或提出其他法律救济途径。

建议：在涉及轻伤二级的因果关系鉴定时，被害人应积极配合司法机关的工作，按照指定的时间和地点到鉴定机构进行鉴定。如果对鉴定结果有异议或认为鉴定过程存在不当行为，可以及时向司法机关反映并寻求法律帮助。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。