结论：小微企业使用腾讯电子签等电子合同平台时，能否按份数收费需结合平台规则、合同性质及法律规定综合判断，具体分以下情况说明：

1. 平台规则优先：需以腾讯电子签的收费模式为准

腾讯电子签作为第三方电子合同服务平台，其收费标准通常由平台自主制定，可能包括按份数收费、按年费/会员费收费、按合同金额比例收费等多种模式。

• 若平台明确支持按份数收费（如每份合同收取固定费用），且该模式不违反法律法规，则小微企业可按此规则付费。
  
• 若平台未提供按份数收费选项（如仅提供包年服务），则企业需遵循平台规则，无法强制要求按份数付费。
  建议：登录腾讯电子签官网或联系客服，确认其当前收费模式及是否支持按份数计费。

2. 合同性质影响：部分合同可能无法通过电子形式签署

根据《电子签名法》第三条，涉及婚姻、收养、继承等人身关系的合同，以及法律、行政法规规定不适用电子文书的合同（如不动产买卖合同），不得通过电子形式签署。

• 若合同属于可电子化范畴（如采购合同、服务协议等），则可通过腾讯电子签签署，并按平台规则付费。
  
• 若合同属于禁止电子化范畴，则需签署纸质合同，此时“按份数收费”问题不适用。
  建议：签署前确认合同类型是否符合电子签名适用范围。

3. 法律合规性：平台收费需公开透明，不得强制消费

根据《消费者权益保护法》第八条、第十条，平台收费需明确告知用户，不得通过技术手段强制用户选择特定付费模式（如捆绑销售、隐藏收费条款）。

• 若平台收费规则清晰、用户可自主选择，则按份数收费合法。
  
• 若平台存在欺诈、胁迫或显失公平的条款（如单方面修改收费标准），用户可主张合同无效或要求退款。
  建议：签署前仔细阅读平台服务协议，保留付费凭证及合同文本。

4. 替代方案：小微企业可协商或选择其他平台

若腾讯电子签的收费模式不符合需求，小微企业可：

• 与平台协商定制化方案（如批量签署优惠）；
  
• 选择其他电子合同平台（如法大大、e签宝等），对比收费模式及功能后决定；
  
• 对高频次、低金额合同，可考虑免费或低成本工具（如微信自带文件传输功能结合纸质签字）。
  

总结：能否按份数收费需以腾讯电子签的规则为准，同时需确保合同类型合法、收费透明。如有具体合同或收费争议，可进一步提供细节，我将为您分析法律风险及应对策略。