针对您提出的“户口本上写的是妻子但没有结婚证签个协议生效吗”这一问题，我们需要从法律的角度进行详细分析。

首先，户口本上登记的信息，虽然能反映一定的家庭关系，但它并不是证明婚姻关系的法定文件。在我国，婚姻关系的成立和解除，都需要依据《中华人民共和国民法典》中关于婚姻家庭的规定来进行，特别是需要办理结婚登记手续，领取结婚证，这才是法律上认可的婚姻关系确立的标志。

接下来，关于您提到的“签个协议”是否生效的问题，这主要取决于协议的内容和性质。如果这份协议是关于财产分割、子女抚养等婚姻相关事宜的约定，那么在没有结婚证（即没有法律认可的婚姻关系）的情况下，这份协议在法律上的效力会受到质疑。因为，婚姻关系的存在是此类协议生效的前提和基础。如果双方并未依法登记结婚，那么他们之间的财产关系、子女抚养关系等，就不能简单地通过一份协议来界定和保障。

此外，即使双方有签订协议的意愿，也建议他们在协议中明确各自的权利和义务，以及协议生效的条件和期限等。但更重要的是，他们应该先依法办理结婚登记手续，确立合法的婚姻关系，然后再根据实际情况签订相关的婚姻协议，以确保协议的法律效力和可执行性。

综上所述，户口本上写的是妻子但并没有结婚证的情况下，单纯签订一份协议并不能确保其在法律上的生效和可执行性。为了保障双方的权益，建议先依法办理结婚登记手续，再根据需要签订相关的婚姻协议。