针对您提出的“显著轻微案件认罪认罚怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

在处理显著轻微且认罪认罚的案件时，法律体系提供了一套相对灵活且人性化的处理机制。这类案件的处理方式主要取决于案件的具体情节、被告人的认罪态度以及法律的相关规定。

首先，认罪认罚从宽制度是贯穿刑事诉讼全过程的重要原则。这意味着，如果被告人自愿认罪并接受处罚，法院在量刑时会将其作为一个重要的从宽情节进行考量。这一制度旨在鼓励被告人积极认罪，减少诉讼成本，同时也有助于实现司法公正和效率。

对于显著轻微且认罪认罚的案件，检察院在审查起诉阶段可能会提出不同的处理意见。根据法律的规定，如果犯罪情节显著轻微且危害不大，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，检察院可以作出不起诉决定。这一决定是基于对案件全面审查后作出的，旨在避免对轻微犯罪的被告人进行不必要的刑事追诉。

如果检察院决定提起公诉，法院在审理时会结合具体案情进行裁判。认罪认罚会作为从宽处罚的重要考量因素。法院会根据被告人的犯罪事实、性质、情节以及社会危害程度，结合其认罪态度、悔罪表现等因素，在法定量刑幅度内从轻、减轻或者免除处罚。对于情节较轻且符合缓刑条件的被告人，法院可能会宣告缓刑，使其在社区中接受改造和监督。

以具体案例为例，如果被告人像小朱那样，因一时贪念参与轻微盗窃案件，但案发后主动投案自首、如实供述犯罪行为并积极退还赃款，表现出良好的认罪悔罪态度，那么检察院在审查时可能会考虑作出不起诉决定。如果决定提起公诉，法院在审理时也会结合其初犯、涉案金额小、主动退赃退赔等情况，在法定量刑幅度内从轻处罚，甚至可能宣告缓刑。

综上所述，对于显著轻微且认罪认罚的案件，处理方式多样且灵活。检察院和法院会根据案件的具体情况和法律的相关规定，作出最合适的处理决定。如果您或您身边的人遇到类似情况，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。