结论：公司与个人签了合作协议后离职，是否需要签署其他文件，主要取决于合作协议的性质、内容以及双方的具体约定。一般来说，若合作协议已明确约定离职相关事宜，则按协议执行；若无明确约定，则建议双方签署离职交接文件或补充协议，以明确双方权利义务，避免后续纠纷。

一、合作协议性质与内容的影响

1. 若合作协议为劳务合同或类似性质：

   • 劳务合同通常规定劳动者提供劳务，用人单位支付报酬，双方关系较为灵活。
   • 若合作协议中已明确约定离职流程、经济补偿、保密义务等，则离职时按协议执行即可，无需额外签署文件。
   • 但需注意：若协议中有未尽事宜或存在歧义，建议双方签署补充协议，明确离职后的权利义务。

2. 若合作协议为劳动合同性质：

   • 劳动合同受《劳动法》、《劳动合同法》等法律法规严格约束。
   • 离职时，用人单位需依法支付经济补偿（如符合法定情形）、办理离职手续（如出具离职证明、转移社保关系等）。
   • 建议：即使合作协议中有离职条款，也建议双方签署离职交接单，明确工作交接、财物归还等事项，确保离职过程顺利。

二、双方具体约定的考量

1. 有明确离职约定：

   • 若合作协议中已明确约定离职条件、流程、经济补偿等，则双方按协议执行即可。
   • 示例：协议中约定“员工离职需提前30日书面通知，公司支付相当于1个月工资的经济补偿”，则离职时按此执行。

2. 无明确离职约定或约定不明：

   • 若合作协议中未涉及离职事宜或约定不明，则建议双方签署离职协议或补充协议。
   • 离职协议内容：可包括离职日期、工作交接、经济补偿（如有）、保密义务、竞业限制（如有）等。
   • 目的：明确双方权利义务，避免离职后因经济补偿、工作交接等问题产生纠纷。

三、法律建议与风险防范

1. 审查合作协议：

   • 离职前，建议双方仔细审查合作协议，明确离职相关条款。
   • 若发现协议存在漏洞或歧义：及时与对方沟通，签署补充协议或离职协议。

2. 签署离职文件：

   • 无论合作协议是否有离职条款，都建议双方签署离职交接单或离职协议。
   • 离职交接单内容：可包括工作交接情况、财物归还情况、未了结事项等。
   • 目的：确保离职过程有序进行，避免后续纠纷。

3. 保留证据：

   • 离职过程中，建议双方保留相关证据，如离职通知、离职协议、工作交接单等。
   • 目的：若后续发生纠纷，可作为维权依据。

最后，离职是职场中常见的现象，但处理不当可能引发纠纷。因此，建议双方在离职前充分沟通，明确离职相关事宜，并签署必要的离职文件。若您在此过程中遇到任何法律问题，欢迎直接向我咨询，我将为您提供专业的法律服务。