无民事行为能力人的离婚案件中，若法定代理人与对方达成协议并要求发给判决书的，法院的处理方式需结合法律规定与案件实际情况进行综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定与理解
《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》的相关规定：
- 根据该解释第九十四条，无民事行为能力人的离婚案件，由其法定代理人进行诉讼。若法定代理人与对方达成协议并要求发给判决书的，法院可根据协议内容制作判决书。但这里使用的是“可”字，意味着法院有一定的自由裁量权，并非必须制作判决书。
婚姻自主权与法定代理权的限制：
- 婚姻自主权是公民的基本权利，包括结婚自由和离婚自由。无民事行为能力人虽不能通过自己的行为取得民事权利、履行民事义务，但其婚姻自主权并不因此受到损害。
- 法定代理人代为处分财产和子女问题通常无争议，但代为决定离婚问题则缺乏明确法律依据。离婚涉及人身权中的婚姻自主权，必须由当事人本人亲自表达意见。
二、法院处理方式的考量因素
协议内容与法律效力：
- 法定代理人与对方达成的协议，若涉及离婚问题，则可能因侵犯无民事行为能力人的婚姻自主权而无效。因为离婚的意思表示必须由婚姻当事人本人直接做出，他人不得代理。
- 若协议仅涉及财产分割和子女抚养问题，且不违反法律规定和公序良俗原则，则法院可以认可其法律效力。
法院的自由裁量权：
- 根据法律规定，法院在处理此类案件时享有一定的自由裁量权。法院会综合考虑双方当事人的婚姻状况、感情是否确已破裂、无民事行为能力人的利益保护等因素，来决定是否制作判决书以及判决的内容。
三、实践中的处理方式
以判决方式结案：
- 多数观点认为，无民事行为能力人的离婚案件应以判决方式结案。因为离婚涉及人身关系，必须由当事人本人表达意见，不宜由其诉讼代理人代替。法院应视双方当事人的婚姻感情是否确已破裂，而相应做出是否准予离婚的判决。
- 若法定代理人与对方达成协议并要求发给判决书的，法院可将协议内容写入判决书，但判决离婚与否仍需根据婚姻感情是否确已破裂来判定。
以调解方式结案的例外情况：
- 若法定代理人与对方达成协议，但未提出要求发给判决书的，且法院认为调解更有利于保护无民事行为能力人的利益，则法院可以以调解方式结案。但这种情况较为少见，因为离婚案件通常涉及人身关系的重大变更，需要更为慎重的处理方式。
四、建议与注意事项
- 法定代理人应谨慎行使权利：法定代理人在代为诉讼时，应严格遵守法律规定，不得侵犯无民事行为能力人的合法权益。特别是涉及离婚问题时，应尊重被代理人的真实意愿。
- 法院应全面审查案件事实：法院在处理此类案件时，应全面审查双方当事人的婚姻状况、感情是否确已破裂、无民事行为能力人的利益保护等因素，确保判决的公正性和合理性。
- 当事人及法定代理人应积极配合法院工作：在诉讼过程中，当事人及法定代理人应积极配合法院的工作，提供必要的证据和材料，以便法院能够全面、准确地了解案件事实并作出公正判决。
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