结论前置：车辆在下雨天不慎掉入沟中，保险公司是否理赔，需根据所购保险种类及事故具体情况来判断。

1. 交强险不覆盖此类事故：交强险（机动车交通事故责任强制保险）主要保障的是因交通事故造成第三方（不包括本车人员和被保险人）的人身伤亡和财产损失。车辆自身因意外掉入沟中，并不属于交强险的赔付范围。

2. 商业车险中的车损险可能覆盖：

   • 若购买了车损险：车损险是商业车险的一种，用于赔偿车辆因碰撞、倾覆、火灾、爆炸、外界物体坠落、倒塌等原因造成的损失。车辆在下雨天不慎掉入沟中，通常会被视为“倾覆”或“意外事故”，因此有可能获得车损险的赔付。但具体赔付金额和条件需依据保险合同中的条款来确定。
   • 免责条款需注意：在车损险的保险合同中，可能会存在一些免责条款，如因驾驶员故意行为、酒驾、无证驾驶等造成的损失不予赔付。此外，如果事故发生时车辆未按照规定进行年检或保险过期，也可能影响赔付。

3. 其他附加险种：除了车损险外，还有一些附加险种可能与此类事故相关，如玻璃单独破碎险（如果车辆掉入沟中导致玻璃破碎）、涉水险（如果车辆因涉水行驶导致发动机损坏等，但需注意涉水险通常有特定的赔付条件，如车辆在静止状态下被水淹和行驶状态下涉水熄火后的二次启动造成的损失可能不赔）等。然而，这些附加险种的赔付也需依据具体的保险合同条款来确定。

建议：在发生此类事故后，应及时联系保险公司报案，并按照保险公司的要求提供相关证明材料（如事故现场照片、交警出具的事故责任认定书等）。同时，仔细阅读保险合同中的条款，了解自己的权益和义务。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。