公司不服行政处罚提起诉讼，但法人不起诉时，法院通常不会对法人的处罚决定一并处理。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、诉讼主体与诉讼标的的独立性
诉讼主体：在行政诉讼中，公司作为独立的法人实体，具有诉讼主体资格。当公司不服行政处罚决定时，它有权以自己的名义提起诉讼。而法人作为公司的代表或负责人，其个人并不直接成为行政诉讼的当事人，除非行政处罚直接针对法人个人。
诉讼标的：行政诉讼的标的通常是行政机关作出的具体行政行为，如行政处罚决定。当公司提起诉讼时，其诉讼标的是针对公司的行政处罚决定。如果法人个人没有受到行政处罚，或者其受到的处罚与公司的处罚是分开的，那么法人个人的处罚决定就不属于公司诉讼的标的范围。
二、法院处理原则
不告不理原则：法院在行政诉讼中遵循“不告不理”的原则，即只有当事人提起诉讼，法院才会对诉讼标的进行审理。如果法人个人没有提起诉讼，法院通常不会主动对其处罚决定进行审理。
诉讼合并的例外情况：虽然一般情况下法院不会对未起诉的法人处罚决定一并处理，但在某些特殊情况下，如法人个人的处罚决定与公司的处罚决定存在紧密关联，且为了诉讼经济和效率考虑，法院可能会考虑将两者合并审理。然而，这种情况需要满足严格的法律条件，并经过法院的审查和决定。
三、法律建议与后续行动
明确诉讼主体与标的：公司在提起行政诉讼时，应明确诉讼主体和诉讼标的，确保诉讼的针对性和有效性。如果法人个人也受到了行政处罚，并且认为该处罚决定违法或不当，那么法人个人应单独提起诉讼。
考虑诉讼合并的可能性：如果法人个人的处罚决定与公司的处罚决定存在紧密关联，且为了诉讼经济和效率考虑，公司或法人个人可以在提起诉讼时向法院提出合并审理的申请。然而，最终是否合并审理将由法院根据具体情况和法律规定进行决定。
寻求专业法律帮助：在处理此类复杂的行政诉讼问题时，建议公司或法人个人寻求专业的法律帮助。律师可以提供详细的法律咨询和诉讼策略指导，帮助当事人更好地维护自己的合法权益。