房屋侵占强制执行费用一般由被执行人承担。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律规定角度

根据相关法律规定，强制执行费用本就由被执行人负担，这一规定的目的是督促被执行人履行法律文书确定的义务。在房屋侵占的强制执行案件中，如果被执行人拒不履行法院判决或裁定，申请人向法院申请强制执行，那么由此产生的执行费用，包括但不限于房屋强制过户、拍卖房屋等执行行为产生的费用，都应由被执行人承担。

二、和解协议角度

如果在执行过程中，申请人与被执行人达成了和解协议，那么关于申请费的负担，双方可以协商解决。如果协商不成，则由法院根据具体情况决定。但需要注意的是，这种情况并不改变强制执行费用原则上由被执行人承担的规定，只是在特定情况下，双方可以通过协商来调整费用的分担方式。

三、实际操作角度

在实际操作中，当法院完成房屋强制执行后，执行费会从被执行人的财产中扣除。这意味着，被执行人不仅需要履行法律文书确定的义务，还需要承担因不履行义务而产生的额外费用。这种设计有助于增强法律的威慑力，促使被执行人主动履行义务。

举例说明：

假设甲与乙因房屋侵占问题诉至法院，法院判决乙将房屋返还给甲，但乙拒不履行。甲遂向法院申请强制执行。在执行过程中，产生了包括房屋评估费、拍卖费等在内的执行费用。根据法律规定，这些费用应由乙承担。如果乙在执行过程中与甲达成了和解协议，并约定了执行费用的分担方式，那么应按照和解协议执行。但如果和解协议未提及执行费用，或者协商不成，则仍由乙承担。

建议：

1. 如果您作为申请人，在申请强制执行前，建议先了解相关法律规定，明确执行费用的承担原则。
2. 在执行过程中，如果与被执行人达成和解协议，务必在协议中明确执行费用的分担方式，以避免后续争议。
3. 如果您对执行费用的承担有疑问，或者遇到被执行人拒不承担执行费用的情况，可以及时向法院反映，寻求法律帮助。

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