结论：申请强制执行后，若借款人仍不还款，法院有权查封并拍卖其自建房，但需满足一定条件。
一、法院查封与拍卖自建房的法律依据
根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，法院在执行过程中有权对被执行人的财产进行查封、扣押、冻结，并在符合法定条件时进行拍卖或变卖，以清偿债务。自建房作为被执行人名下的财产，同样属于法院可执行的范围。
二、查封与拍卖自建房的具体条件
自建房属于被执行人财产：
- 法院需确认自建房确实属于被执行人所有，这通常通过房产登记信息、建设审批文件等证据来认定。
- 若自建房存在权属争议，如涉及家庭共有财产或继承纠纷，法院可能会暂缓执行，待权属明确后再行处理。
自建房具有可执行性：
- 自建房需具备可分割性或整体处置价值，以便法院进行拍卖或变卖。
- 若自建房因地理位置偏远、结构特殊等原因难以变现，法院可能会考虑其他执行措施，如限制被执行人高消费、纳入失信被执行人名单等。
遵循法定程序：
- 法院在查封自建房前，需向被执行人发出执行通知书，责令其履行义务。
- 查封过程中，法院需制作查封清单，并通知被执行人或其成年家属到场。
- 拍卖自建房时，法院需委托具有资质的拍卖机构进行，并遵循公开、公平、公正的原则。
三、查封与拍卖自建房的实践案例
- 案例一：某被执行人名下有一处自建房，位于城市郊区，价值较高。法院在确认权属无误后，依法查封了该房产，并通过拍卖程序将其变现，所得款项用于清偿债务。
- 案例二：另一被执行人名下的自建房因涉及家庭共有财产纠纷，法院在查封前进行了详细的权属调查，并组织了听证会。最终，在权属明确后，法院才对该房产进行了查封和拍卖。
四、被执行人可能采取的应对措施及法律后果
提出执行异议：
- 被执行人若认为法院查封、拍卖自建房的行为违法或侵犯其合法权益，可向法院提出执行异议。
- 法院将审查异议理由，并作出裁定。若异议成立，法院将撤销或变更相关执行行为。
履行义务或达成和解：
- 被执行人可在执行过程中主动履行义务，或与债权人达成和解协议，以避免房产被查封和拍卖。
- 若被执行人拒不履行义务且未达成和解，法院将依法继续执行程序。
面临法律制裁：
- 若被执行人存在隐匿财产、转移资产等逃避执行行为，法院可依法对其采取罚款、拘留等制裁措施。
- 情节严重的，被执行人还可能构成拒不执行判决、裁定罪，面临刑事处罚。
五、建议与注意事项
积极配合法院执行工作：
- 债权人应积极配合法院的执行工作，提供被执行人的财产线索和相关信息。
- 被执行人应如实申报财产状况，避免逃避执行行为。
关注执行程序进展：
- 债权人应关注执行程序的进展情况，及时了解房产查封、拍卖等关键节点的信息。
- 被执行人应关注法院的执行通知书和裁定书等法律文书，确保自身权益不受侵害。
寻求专业法律帮助：
- 若在执行过程中遇到复杂问题或争议，建议寻求专业律师的帮助。
- 律师可提供法律咨询、代理执行异议、参与和解谈判等法律服务，以维护当事人的合法权益。
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