结论是：车管所因您涉及交通事故且对方负主要责任而不让您报考摩托车驾驶证的做法，通常是不正确的，但具体还需根据事故处理情况及当地车管所的具体规定来判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、交通事故责任与报考驾驶证的关系
一般原则：交通事故的责任划分，主要影响的是事故双方在民事赔偿和可能的行政处罚（如罚款、扣分等）方面的责任。它并不直接决定您是否有资格报考或持有驾驶证。报考驾驶证的主要条件通常包括年龄、身体条件、无严重交通违法记录等，而并不涉及是否发生过交通事故或事故中的责任划分。
特殊情况：然而，如果交通事故中您存在严重违法行为（如酒驾、逃逸等），且这些行为被记录在案，那么根据相关规定，您可能会在一定期限内被禁止报考或持有驾驶证。但这种情况下的禁止，是基于您的违法行为，而非单纯的事故责任划分。
二、车管所拒绝报考的可能原因及合法性分析
可能原因：车管所可能基于某些内部规定或对相关法规的误解，认为涉及交通事故且对方负主要责任的人员不应报考驾驶证。但这种做法通常缺乏明确的法律依据。
合法性分析：除非有明确的法规或规章规定，在特定情况下（如存在严重交通违法行为）禁止报考驾驶证，否则车管所无权仅因您涉及交通事故且对方负主要责任而拒绝您报考。如果车管所的做法没有明确的法律依据，那么这种做法可能是不合法的。
三、建议与后续行动
核实规定：首先，您可以向车管所询问其拒绝您报考的具体依据，并要求其提供相关的法规或规章。如果车管所无法提供明确的依据，那么其做法可能存在问题。
提出异议：如果您认为车管所的做法不合法或不合理，您可以向其上级主管部门提出异议，要求其纠正错误的做法。
法律途径：如果车管所坚持其做法，且您认为其侵犯了您的合法权益，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益，如向法院提起行政诉讼。
总结来说，车管所因您涉及交通事故且对方负主要责任而不让您报考摩托车驾驶证的做法，在缺乏明确法律依据的情况下，通常是不正确的。如果您遇到此类问题，建议先核实车管所的规定和依据，然后提出异议或通过法律途径来维护自己的权益。如果您还有其他关于交通事故或驾驶证报考的法律问题，欢迎直接向我咨询。