交通事故扣留机动车时，如果存在违法行为，驾驶员不一定会收到短信通知，这主要取决于多种因素。以下是对此问题的详细分析：
一、可能收到短信通知的情况
注册并开通服务：
- 如果驾驶员在交通管理部门或相关平台注册了车辆信息和手机号码，并明确开通了违章短信通知服务，那么当车辆因交通事故被扣留且存在违法行为时，系统可能会自动发送短信通知至预留的手机号码。短信内容通常包含违章时间、地点、具体违法行为等信息。
部分地区主动通知：
- 在某些地区，为了提高交通违法信息的告知率，交通管理部门可能会主动向本地区登记注册的机动车车主发送违章短信通知，无论车主是否主动申请该服务。但这种情况并非普遍存在，且可能因地区而异。
二、可能收不到短信通知的情况
未注册或信息未更新：
- 如果驾驶员未在交通管理部门登记预留有效的手机号码，或预留的手机号码已变更但未及时更新，那么将无法收到违章短信通知。因此，驾驶员在更换手机号码后，应及时到车管所或通过相关平台修改预留号码。
特殊情况或系统问题：
- 在短信发送系统出现故障、网络问题、通信运营商信号问题或交通管理相对不完善、信息更新滞后的地区，可能会出现短信通知延迟或无法发送成功的情况。
现场处罚情况：
- 对于现场被交警查到并确认签字的违章行为，如交通事故中涉及的违法行为，驾驶员通常不会收到短信通知，而是需要在规定时间内自行去交警队接受处理。
三、法律建议与处理措施
- 主动管理个人设置：驾驶员应确保在交通管理部门或相关平台注册并开通违章短信通知服务（如适用），并保持信息的准确更新。这样，一旦车辆因交通事故被扣留且存在违法行为，就能及时收到通知。
- 定期查询交通违章记录：驾驶员应定期通过交通网站、手机APP等途径查询交通违章记录，以确保及时掌握驾驶证扣分情况。
- 及时处理违章行为：一旦发现违章行为，驾驶员应及时处理，避免产生滞纳金等不必要的费用。同时，对于交通事故中涉及的违法行为，更应积极配合交警部门的调查和处理工作。
总结来说，交通事故扣留机动车时，如果存在违法行为，驾驶员是否收到短信通知并非绝对。为了确保及时掌握违章信息，驾驶员应主动管理个人设置、定期查询交通违章记录，并及时处理违章行为。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。