结论：网贷逾期3个月后已还款，过去两年无其他不良记录，理论上不影响购房贷款申请，但最终能否获批需结合征信记录、收入稳定性、负债率及银行政策综合判断。

1. 征信记录的影响

• 逾期记录的保留期：根据《征信业管理条例》，逾期记录自还清之日起保留5年。若您2年前已还清逾期款项，当前征信报告中该笔逾期记录仍存在，但银行会重点考察近2年的还款记录。若近2年无其他逾期或不良记录，对贷款申请的影响会显著降低。
  
• 银行审核重点：银行会综合评估您的信用历史，包括逾期次数、金额、时长等。单次短期逾期（如3个月）且已结清，通常不会被视为“严重失信”，但若存在多次逾期或当前仍有未结清债务，可能被拒贷。

2. 收入与负债能力的审核

• 还款能力是核心：银行会通过收入证明、银行流水等材料，评估您的月收入是否覆盖房贷月供及其他负债（如信用卡、其他贷款）。若您的收入稳定且负债率较低（通常要求负债率不超过50%），逾期记录的影响会被弱化。
  
• 首付比例的影响：若您能提供更高比例的首付（如30%以上），银行可能更倾向于批准贷款，因为首付比例高意味着违约风险降低。

3. 银行政策与贷款类型

• 不同银行的审核差异：国有大行（如工行、建行）对征信要求较严格，而部分股份制银行或城商行可能更灵活。若在一家银行被拒，可尝试其他银行。
  
• 公积金贷款的优势：若您符合公积金贷款条件，其审核标准通常比商业贷款宽松，逾期记录的影响可能更小。

4. 建议与操作步骤

• 提前自查征信报告：通过中国人民银行征信中心官网或线下网点查询个人征信，确认逾期记录是否已更新为“已结清”，并检查是否有其他未知的不良记录。
  
• 优化贷款材料：提供稳定的收入证明（如工资流水、税单）、资产证明（如存款、房产）等，增强银行对还款能力的信心。
  
• 咨询贷款经理：在申请前与银行贷款经理沟通，说明逾期原因（如临时资金周转困难）并强调已结清，部分银行可能酌情考虑。

总结：网贷逾期3个月后已还款，且过去两年信用记录良好，购房贷款获批的概率较高。但需确保当前收入稳定、负债率可控，并选择审核相对宽松的银行或贷款产品。如有具体征信报告或收入情况，可进一步分析优化方案。