面对商铺被非法侵占并主张经济补偿的情况，您可以按照以下步骤来处理：

一、确认侵占行为的非法性

首先，您需要明确该侵占行为是否合法。如果确认是不合法的侵占，那么您就有权依据相关法律法规来主张自己的权利。

二、收集证据

在主张权利之前，收集充分的证据是至关重要的。这些证据应包括但不限于：

• 侵占行为发生的时间、地点
• 参与侵占的人员信息
• 商铺被侵占期间的现场照片、视频
• 商铺产权证明或租赁合同等证明您对商铺拥有合法权利的文件
• 因侵占行为导致的直接损失（如租金损失）和间接损失（如生意变差导致的利润损失）的相关凭证，如财务报表、客户流失记录等

三、与侵占方协商

在收集到足够证据后，您可以尝试与侵占方进行协商，明确赔偿的范围和金额。协商时，应保持冷静和理性，以事实为依据，以法律为准绳，争取达成双方都能接受的赔偿协议。

四、提起诉讼

如果协商无果，您可以向法院提起诉讼，要求侵占方承担相应的赔偿责任。在提起诉讼时，您需要：

1. 撰写起诉状：明确原告（您自己）和被告（侵占方）的信息，诉讼请求（如停止侵占、赔偿损失等），以及事实和理由。
2. 提交起诉材料：将起诉状及相关证据提交给商铺所在地的法院。
3. 参与庭审：法院受理后会安排开庭审理。在庭审中，您需要出示证据来证明自己的主张。
4. 等待判决：法院会根据具体情况作出判决，要求侵占方承担相应的赔偿责任。

五、赔偿范围与计算方式

在主张赔偿时，您需要明确赔偿的范围和计算方式。赔偿范围一般包括：

• 直接损失：如商铺被侵占期间的租金损失、因侵占行为导致的财物损坏或丢失等。
• 间接损失：如因侵占行为导致的生意变差、客户流失、利润减少等。

赔偿金额的计算应基于实际损失，如果难以确定实际损失，可以参照商铺在被侵占期间的市场租金或其他合理方式来确定。

六、执行判决

如果法院判决侵占方承担赔偿责任，但对方不履行判决，您可以向法院申请强制执行，以确保自己的权益得到保障。

七、寻求专业帮助

在整个过程中，如果您对如何准确计算损失、通过何种有效方式维权等还有疑问，不要犹豫寻求专业律师或法律机构的帮助。他们可以提供更具体、更专业的建议和指导。

总之，面对商铺被非法侵占并主张经济补偿的情况，您需要保持冷静和理性，收集充分证据，尝试与侵占方协商，协商无果则提起诉讼，并明确赔偿范围和计算方式。同时，不要忘记寻求专业帮助以确保自己的权益得到最大保障。