工商部门在发放牌照时，通常不会直接核对合同章的真假。这一结论主要基于以下几点分析：

1. 工商部门的职责范围：

   • 工商部门的主要职责是监管市场主体的注册、登记、变更等事务，确保市场主体的合法性和合规性。在发放牌照的过程中，工商部门主要关注的是申请材料的真实性、完整性和合规性，如公司章程、股东信息、注册资本等，而非合同章的真假。

2. 合同章的核对主体：

   • 合同章的真假通常不是工商部门在发放牌照时需要核对的重点。合同章的核对更多发生在合同签订、履行或争议解决过程中，由合同双方或相关法律机构进行。例如，在合同纠纷中，法院或仲裁机构可能会对合同章的真假进行鉴定，以确定合同的效力。

3. 实际操作中的可能性：

   • 虽然在某些特殊情况下，工商部门可能会对申请材料中的某些印章进行形式上的审查，但这并不等同于对合同章真假的全面核对。这种审查更多是基于对申请材料完整性和合规性的考虑，而非对合同章真假的深入鉴定。

4. 法律建议：

   • 如果您在申请牌照过程中担心合同章的真假问题，建议您在提交申请材料前自行核对合同章的真实性，并确保所有申请材料的真实性和合规性。这样不仅可以减少工商部门对申请材料的质疑，还可以避免因合同章问题导致的法律纠纷。
   • 如果您在合同签订或履行过程中遇到合同章真假的问题，建议您及时咨询专业律师，以便通过法律途径维护自己的合法权益。

总结来看，工商部门在发放牌照时通常不会直接核对合同章的真假。但为了确保申请材料的真实性和合规性，以及避免后续的法律纠纷，建议您在提交申请材料前自行核对合同章的真实性，并在遇到问题时及时咨询专业律师。如果您有任何关于合同纠纷、涉外法律、公司事务等方面的法律问题，都可以直接向我咨询。