结论：交了土地出让金的土地变成耕地是否违法，需根据具体情况判断，一般而言，若未经合法程序擅自改变土地用途，则构成违法。
一、土地出让金与土地用途的关系
土地出让金是土地使用者为获得土地使用权而支付的费用，其支付通常与土地用途的确定紧密相关。在支付土地出让金时，土地用途（如工业用地、商业用地、住宅用地等）通常已明确，并作为出让合同的重要组成部分。因此，土地用途的变更并非随意可行，而是需要遵循严格的法律程序。
二、擅自改变土地用途的法律后果
行政责任：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，未经批准，擅自将土地出让合同约定的用途改变为耕地的，可能面临土地管理部门的行政处罚，包括责令限期改正、没收违法所得、罚款等。
民事责任：
- 若因擅自改变土地用途导致合同目的无法实现，土地出让方可能要求解除合同，并要求受让方承担违约责任，包括赔偿损失等。
刑事责任（在极端情况下）：
- 若擅自改变土地用途的行为情节严重，如涉及大量土地、造成重大损失或恶劣社会影响，可能构成犯罪，依法追究刑事责任。但这种情况较为罕见，通常需要达到一定的严重程度。
三、合法变更土地用途的程序
若确实需要将已支付土地出让金的土地变为耕地，应遵循以下合法程序：
- 提出申请：向当地土地管理部门提出变更土地用途的申请。
- 审批程序：土地管理部门对申请进行审查，包括土地利用规划、环境影响评估等，必要时需组织听证会。
- 签订补充协议：若申请获得批准，需与土地出让方签订补充协议，明确新的土地用途、出让金调整等事项。
- 办理相关手续：根据补充协议，办理土地使用权变更登记等相关手续。
四、特殊情况分析
- 政策调整：若因国家政策调整（如耕地保护政策加强），要求将部分已出让土地恢复为耕地，这种情况下可能涉及政府与土地使用者的协商和补偿机制，但同样需要遵循法定程序。
- 历史遗留问题：对于历史上因各种原因形成的土地用途与实际使用不符的情况，需根据具体情况和当地政策进行妥善处理，通常也需要经过法定程序进行纠正。
建议：若您面临类似问题，建议首先查阅与土地出让相关的合同文件，了解土地用途的具体约定；其次，咨询当地土地管理部门或专业律师，了解变更土地用途的具体程序和要求；最后，根据咨询结果和实际情况，决定是否申请变更土地用途或采取其他合法措施。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。