面对民间借贷案件中被告举证已还部分款项的情况，作为被告，你需要采取一系列系统且详细的应对策略来维护自己的合法权益。以下是我为你整理的具体步骤和建议：
一、初步应对与材料核实
仔细查阅诉讼材料：
- 认真阅读原告提交的起诉状、证据清单等法律文书，明确原告的诉讼请求，包括借款本金、利息数额及计算方式，以及其依据的事实和理由。
- 评估原告证据的种类、内容及对你的不利程度，特别关注借条、转账记录等关键证据的真实性、关联性和合法性。
核实借款事实与还款情况：
- 仔细审查借款事实，确认借款是否真实存在，以及借款金额、利息、还款期限等是否与原告主张相符。
- 核实自己已还款的部分，确保有充分的证据支持，如银行转账凭证、微信或支付宝转账截图、收条等。
二、准备答辩与收集证据
撰写并提交答辩状：
- 在规定时间内向法院提交答辩状，针对原告的诉讼请求和事实理由进行回应。
- 详细说明你对借款事实的看法及理由，包括已还款的部分和金额，以及你对剩余借款的还款意愿或异议。
积极收集反驳证据：
- 除了已还款的凭证外，如认为借款合同存在无效或可撤销情形（如高利贷、胁迫等），应提供聊天记录、证人证言等相关证据。
- 确保所有证据都是真实、合法且与案件相关的，以便在庭审中有效支持你的观点。
三、庭审阶段应对策略
按时出庭并遵守纪律：
- 按照法院传票上的开庭时间和地点准时参加庭审，遵守法庭纪律和程序。
- 保持冷静和理智，尊重法官和对方当事人，避免情绪化行为。
有效陈述与辩论：
- 认真听取原告陈述，针对其陈述发表自己的意见。
- 在法庭辩论环节，围绕争议焦点有条理地阐述自己的观点和理由，特别是已还款的部分和金额，反驳对方不合理的主张。
质证环节的关键作用：
- 对原告提交的证据进行质证，从真实性、关联性、合法性三个方面发表意见。
- 如怀疑证据真实性，可申请笔迹鉴定；如证据与本案关联性不强，应指出其不能证明原告主张；如证据取得方式不合法，应提出不应被采纳。
四、判决与执行阶段处理
关注并履行判决结果：
- 庭审结束后，密切关注法院的判决结果。如对判决不服，可在规定时间内提起上诉。
- 如法院判决支持原告的全部或部分诉讼请求，且你认可该判决，应按照判决书规定的履行期限和方式履行义务，包括支付剩余借款和可能的逾期利息。
执行阶段的配合与后果：
- 若进入执行程序，应积极配合法院的执行工作，如实报告财产状况，按执行通知履行还款义务。
- 如不履行判决义务，可能会面临被列入失信被执行人名单、限制高消费、影响个人信用记录等不利后果，情节严重的还可能会被追究刑事责任。
五、额外建议
- 考虑聘请专业律师：律师能提供专业法律意见和指导，帮助你更好地应对诉讼过程，提高胜诉几率。
- 尝试协商解决：在整个过程中，也可考虑与原告协商解决纠纷，以达成和解或调解为最佳结果，避免长时间的诉讼和可能的负面后果。
总之，作为民间借贷案件的被告，面对举证已还部分款项的情况，你需要保持冷静、理性，通过合法的途径和方式维护自己的合法权益。注重证据的收集和质证，合理利用法律资源，努力争取最有利的结果。