关于您提出的“合同扫描盖章打印出是否有效”的问题，这确实是一个涉及合同法律效力的重要疑问。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，合同扫描件打印后加盖公章，在双方均认可合同内容及履行的情况下，是具有法律效力的。这是因为该扫描件可以被视为双方真实意思表示的物化形式，即双方都同意并接受了合同中的各项条款。
然而，我们也必须认识到，在双方发生争议时，扫描件的法律效力可能会受到质疑。这是因为扫描件本身是原件的复印件，从技术上讲，存在被篡改的可能性。因此，在诉讼争议中，扫描件的证明效力相对较弱，无法单独作为定案依据。
如果权利人仅仅以扫描件主张权利，而对方又对该合同内容不予认可，那么权利人就需要提供其他相关联的证据进行佐证。这些证据需要能够使得扫描件的真实性达到高度盖然性，即让法院确信该扫描件确实是双方真实意思表示，从而才能将其作为定案依据。
为了避免后续风险，我建议您在采用合同扫描件加盖公章的形式时，可以采取以下应对措施：
在完成合同扫描件的互相传输后，仍要求合同相对方寄送合同纸质原件。这样可以确保双方都有一份真实的、未经篡改的合同原件作为备份。
对于长期交易的订单合同，可以进行集中定期邮寄。这样既可以减少邮寄成本，又可以确保合同的连续性和真实性。
考虑采用线上平台签署电子合同。电子合同具有更高的安全性和便捷性，可以大大降低合同被篡改的风险。
综上所述，虽然合同扫描件打印后加盖公章在双方认可的情况下具有法律效力，但在发生争议时可能会受到质疑。因此，为了避免后续风险，建议您采取上述应对措施来确保合同的法律效力和真实性。