当合同被判定无效，但已经产生了事实费用时，处理这些费用需要遵循一定的法律原则和程序。以下是对这一问题的详细解答：

首先，我们要明确的是，基于无效合同取得的财产应当予以返还。这意味着，如果一方因为合同而取得了对方的财产，那么在合同被判定无效后，应将该财产返还给对方，以恢复双方在合同订立前的财产状态。这是处理无效合同后财产问题的基本原则。

其次，对于不能返还或者没有必要返还的财产，应当进行折价补偿。例如，如果合同涉及的是原材料等已经消耗或无法返还的物品，那么应按照市场价值或其他合理方式进行折价补偿。这样既能确保受损方的利益得到一定程度的弥补，又能体现公平原则。

再者，有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失。如果合同无效是由于一方的过错导致的，那么该方应承担赔偿责任，以弥补对方因合同无效而遭受的经济损失。如果双方都有过错，那么应根据各自的过错程度来确定应承担的赔偿份额。

最后，对于因合同无效而产生的其他费用，如为履行合同而支出的合理费用等，应根据双方的过错情况及公平原则进行分担。这意味着，双方需要共同协商，根据各自的过错程度和实际情况来合理分担这些费用。

综上所述，当合同被判定无效但已经产生了事实费用时，我们应遵循返还财产、折价补偿、过错赔偿和费用分担等原则来处理。这些原则旨在确保双方之间的财产纠纷得到妥善解决，同时体现公平、合理的法律精神。如果您在处理此类问题时遇到困难，建议咨询专业的法律人士以获取更具体的指导和帮助。