合同变更后被变更部分具有新的法律效力，取代原合同中的相应条款。具体分析如下：
变更内容的取代与新生效：
- 根据《中华人民共和国民法典》第五百四十三条，当事人协商一致，可以变更合同。合同变更后，被变更的部分即失去原法律效力，取而代之的是新的合同条款。例如，如果原合同中约定的货物数量是100件，后经双方协商变更为80件，那么变更后的数量条款即为80件，原100件的数量条款不再有效。
未变更部分的持续有效：
- 合同变更仅影响被变更的部分，未涉及的其他条款仍按原约定执行，不受影响。这意味着，除了被明确变更的部分外，合同的其他内容仍然保持其原有的法律效力。
对当事人权利义务的影响：
- 变更后的合同对双方均具有法律约束力。当事人应依据变更后的合同内容行使权利、履行义务。如果一方违反变更后的合同条款，将构成违约，并需承担相应的违约责任。
合法性要求：
- 合同变更必须合法合规，不得存在欺诈、胁迫等违法情形，也不得损害国家利益、社会公共利益或第三方利益。否则，变更可能无效，并可能受到法律制裁。
综上所述，合同变更后被变更部分具有新的法律效力，双方当事人应严格按照变更后的合同条款履行各自的权利和义务。如有进一步需要，您可以继续咨询我。