病假当天，工资通常不会被全额扣除，但可能会按照一定比例支付病假工资，且该工资不得低于当地最低工资标准的80%。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定
根据《关于贯彻执行〈劳动法〉若干问题的意见》第五十九条，职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期间内，企业应按有关规定支付其病假工资或疾病救济费。这些费用可以低于当地最低工资标准支付，但不得低于最低工资标准的80%。这意味着，即使员工请病假，其工资也不会被全额扣除，而是会按照一定比例支付。
二、具体情况分析
劳动合同约定：如果劳动合同中有明确关于病假工资支付的特别约定，且该约定不违反法律规定，那么应按照合同约定执行。这体现了合同自由原则，但同时也受到法律的限制，即病假工资不得低于最低工资标准的80%。
用人单位规章制度：用人单位的规章制度若经法定程序制定并已向劳动者公示，其中关于病假工资的规定也可作为参考依据。但同样，这些规定不得违反法律的强制性规定。
实际操作中的变通：在实际操作中，一些用人单位可能会根据员工的实际情况和公司的经营状况，对病假工资进行一定的调整。但无论如何调整，都必须确保病假工资不低于当地最低工资标准的80%。
三、法律建议
了解自身权益：作为员工，应了解自己的合法权益，包括病假期间的工资支付标准。如果用人单位全扣病假当天工资，员工有权要求用人单位按照规定支付工资。
与用人单位协商：如果发现用人单位在病假工资支付方面存在问题，员工可以先与用人单位进行沟通协商，要求其按照规定支付工资。
寻求法律援助：如果协商不成，员工可以向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位改正；也可以申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
四、可能后果
如果用人单位违反法律规定，全扣病假当天工资或支付的病假工资低于最低工资标准的80%，则可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令改正、罚款等。同时，员工也有权通过法律途径要求用人单位支付拖欠的工资及相应的经济补偿。
综上所述，病假当天工资通常不会被全额扣除，而是会按照一定比例支付病假工资，且该工资不得低于当地最低工资标准的80%。如果遇到用人单位违反规定的情况，员工应积极维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。