不得以格式不符为由进行废标，这一做法的法律依据主要来源于《中华人民共和国招标投标法》及其相关规定。以下从不同角度对此进行详细分析：
一、法律依据的直接规定
《中华人民共和国招标投标法》的相关规定：
- 该法并未直接规定“不得以格式不符为由进行废标”，但强调了招标活动的公平、公正和公开原则，以及招标文件应当明确评标标准和方法。这意味着，评标过程应当基于招标文件规定的实质性要求进行，而非仅仅基于格式问题。
- 具体来说，如果招标文件未将格式要求列为实质性条款，那么投标文件的格式不符通常不应成为废标的理由。因为格式问题往往属于形式性要求，而非影响投标实质内容的关键因素。
《中华人民共和国招标投标法实施条例》的补充规定：
- 该条例进一步细化了招标投标法的相关规定，强调了评标委员会应当按照招标文件确定的评标标准和方法，对投标文件进行评审和比较。
- 如果招标文件未明确格式不符为废标条件，或者格式问题未对投标文件的实质性内容产生影响，那么评标委员会不得仅凭格式不符就作出废标决定。
二、法律原则的适用
公平、公正原则：
- 招标投标活动应当遵循公平、公正的原则，确保所有投标人在同等条件下竞争。如果仅以格式不符为由进行废标，可能会损害其他投标人的合法权益，破坏招标活动的公平性和公正性。
实质重于形式原则：
- 在法律适用中，实质重于形式是一个重要原则。对于投标文件而言，其实质性内容（如技术方案、报价等）远比形式性内容（如格式）更为重要。因此，在评标过程中，应当更加关注投标文件的实质性内容是否符合招标文件的要求。
三、实际操作中的建议
明确招标文件中的实质性条款：
- 在编制招标文件时，应当明确哪些条款是实质性的，哪些条款是形式性的。对于实质性条款，应当设定严格的评审标准；对于形式性条款，则可以适当放宽要求。
合理设定废标条件：
- 废标条件应当明确、具体且合理。不得将格式不符等非实质性问题作为废标条件。同时，废标条件应当在招标文件中明确告知所有投标人，以确保招标活动的透明度和公正性。
加强评标过程的监督和管理：
- 评标过程应当受到严格的监督和管理，确保评标委员会按照招标文件确定的评标标准和方法进行评审。对于评标过程中出现的违规行为，应当及时进行纠正和处理。
若在实际操作中遇到以格式不符为由进行废标的情况，且该格式问题并未在招标文件中明确列为废标条件或未对投标文件的实质性内容产生影响，那么这种废标决定可能是不合法的。此时，可以向招标人提出异议或向相关监管部门投诉，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。