结论是：在双方对账后另打欠条的情况下，起诉通常是按照欠条来起诉的，但还需结合微信转账记录等其他证据来证明借款事实。以下是对这一问题的详细分析：
一、欠条的法律效力
欠条作为债权债务关系的书面凭证，具有明确的法律效力。它证明了双方之间存在债权债务关系，并明确了债务的金额、偿还期限等关键信息。在起诉时，欠条是证明借款事实的重要证据之一。
二、微信转账记录的作用
虽然欠条是起诉的重要依据，但微信转账记录同样具有不可忽视的作用。它证明了款项的实际交付情况，是借款事实发生的有力证据。在起诉时，应将微信转账记录作为辅助证据，与欠条一同提交给法院，以形成完整的证据链。
三、起诉时的证据要求
- 欠条：作为债权债务关系的书面凭证，欠条应明确记载借款金额、偿还期限、利息等关键信息，并由双方签字或盖章确认。
- 微信转账记录：应包含转账时间、转账金额、转账双方信息等关键内容，以证明款项的实际交付情况。
- 其他辅助证据：如聊天记录、语音短信等，这些证据可以进一步证明借贷合意的存在，以及借款的具体经过和细节。
四、起诉流程
- 准备起诉材料：包括起诉状、欠条、微信转账记录、其他辅助证据等。起诉状应明确记载原被告信息、诉讼请求、事实与理由等关键内容。
- 向法院立案：将准备好的起诉材料提交给有管辖权的法院进行立案。法院将对材料进行审查，符合立案条件的将予以受理。
- 参加庭审：在庭审过程中，应清晰陈述事实，出示证据，进行辩论。法院将根据双方举证、质证情况进行判决。
- 执行判决：若胜诉后对方不履行判决，可申请强制执行，以维护自身合法权益。
五、注意事项
- 证据的真实性与关联性：在起诉时，应确保所提交的证据真实、合法且与案件有关联。虚假证据或无关证据可能导致诉讼失败或承担法律责任。
- 诉讼时效：应注意诉讼时效问题，避免因超过时效而影响自身权益。一般来说，民间借贷的诉讼时效为三年，自知道或应当知道权利被侵害之日起计算。
- 法律咨询：在起诉前或诉讼过程中，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和策略指导。
举例说明：假设您与对方通过微信进行了多笔转账，并在对账后另打了欠条。在起诉时，您应将欠条作为主要证据提交给法院，同时附上微信转账记录和其他辅助证据（如聊天记录），以证明借款事实的发生和款项的实际交付情况。这样，法院将更有可能支持您的诉讼请求。