超限运输13.9吨不可以按14吨处罚。具体分析如下：

法规依据

根据《超限运输车辆行驶公路管理规定》第四十三条第1款第2项的规定，对于货运车辆运载货物总质量超限的处罚标准是按照超出核定总质量限额的具体吨数来确定的，并且明确列出了不同超出吨数对应的罚款金额。

处罚标准

• 超出核定总质量限额但未超过1000千克的，予以警告；
• 超过1000千克的，每超1000千克罚款500元，最高不得超过30000元。

同时，规定中明确列出了不同超出吨数对应的具体罚款金额，例如：

• 13吨以上14吨以下，处6500元罚款；
• 14吨以上15吨以下，处7000元罚款；
• 以此类推。

具体案例分析

以用户提出的超限运输13.9吨为例，根据上述处罚标准，13.9吨属于“13吨以上14吨以下”的范畴，因此应按照这一档次的处罚标准执行，即处6500元罚款，而不是按照14吨来处罚。

结论

综上所述，超限运输13.9吨不能按14吨处罚，而应按照13吨以上14吨以下的档次处6500元罚款。这是根据《超限运输车辆行驶公路管理规定》中的明确处罚标准得出的结论。如果有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。