协商还款后仍发账单并扣除利息，可能存在以下几种情况：

1. 协商内容未全面覆盖：

   • 协商范围有限：双方协商还款时，可能仅就本金部分或部分利息的减免达成一致，而未对全部利息进行减免。因此，在还款过程中，未协商减免的利息部分仍会按照原合同约定继续计算并扣除。
   • 建议：仔细审查协商还款协议的内容，确认是否涵盖了所有应减免的利息部分。如有遗漏，可与债权人进一步沟通，争取对剩余利息进行减免。

2. 协商还款协议未生效或存在瑕疵：

   • 协议未生效：协商还款协议可能因未满足法定生效条件（如未签字盖章、未履行必要手续等）而未生效。在此情况下，原合同条款仍然有效，债权人仍有权按照原合同约定收取利息。
   • 协议存在瑕疵：协商还款协议可能存在条款不明确、表述模糊等瑕疵，导致双方对协议内容产生争议。在此情况下，债权人可能按照对自己有利的解释继续收取利息。
   • 建议：确保协商还款协议已经双方签字盖章并履行了必要手续，使其具有法律效力。同时，仔细审查协议条款，确保表述清晰、明确，避免产生争议。

3. 债权人单方面变更协商内容：

   • 单方面变更：在协商还款后，债权人可能因各种原因（如资金需求、风险控制等）单方面变更协商内容，如提高利息率、缩短还款期限等。这种行为通常违反了协商还款协议的约定，也损害了债务人的合法权益。
   • 建议：如发现债权人单方面变更协商内容，债务人应及时与债权人沟通，要求其按照原协商还款协议履行义务。如沟通无果，债务人可考虑通过法律途径维护自己的合法权益。

4. 系统或操作错误：

   • 系统错误：在自动化还款系统中，可能因系统故障或错误导致账单生成和利息扣除出现异常。这种错误通常与协商还款协议本身无关，而是由于技术原因造成的。
   • 操作错误：债权人或债务人在操作还款过程中可能因疏忽或错误导致账单生成和利息扣除出现异常。例如，未正确输入还款金额、未选择正确的还款方式等。
   • 建议：如发现账单生成和利息扣除存在异常，债务人应及时与债权人联系，核实情况并要求其进行更正。同时，债务人也可自行检查还款操作是否正确，避免因操作错误导致不必要的损失。

针对以上情况，债务人可采取以下措施：

• 仔细审查协商还款协议：确保协议内容全面、明确，并已经双方签字盖章并履行了必要手续。
• 及时与债权人沟通：如发现账单生成和利息扣除存在异常或债权人单方面变更协商内容，债务人应及时与债权人沟通，要求其进行更正或按照原协议履行义务。
• 考虑法律途径：如沟通无果或债权人拒绝履行义务，债务人可考虑通过法律途径（如起诉、申请仲裁等）维护自己的合法权益。