本诉按自动撤诉处理后，反诉仍然有效，且法院通常会继续审理。以下从不同角度为您详细分析：

一、反诉的独立性

反诉是一个独立的诉讼请求，其存在并不完全依赖于本诉。根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》的相关规定，反诉与本诉的诉讼请求可以基于相同法律关系、诉讼请求之间具有因果关系，或者基于相同事实，但反诉本身具有独立性。这意味着，即使本诉被撤回或按自动撤诉处理，反诉仍然可以作为一个独立的案件继续审理。

二、具体处理方式

1. 本诉撤回但反诉符合受理条件：

   • 若反诉本身符合起诉条件，且法院已经立案，那么本诉的撤回不会影响反诉的继续审理。例如，在一起合同纠纷中，原告起诉被告要求支付货款（本诉），被告反诉原告要求赔偿因产品质量问题造成的损失（反诉）。如果原告在开庭前撤诉，只要被告的反诉证据充分、诉求明确，法院将继续审理被告的反诉请求。

2. 本诉与反诉合并审理的情形：

   • 若本诉与反诉基于同一法律关系或事实，法院通常会合并审理以提高效率。此时，本诉撤回可能导致两种情况：
     • 如果反诉仍然满足独立审理的条件（如证据完整、诉求明确），法院可以单独推进反诉的审理。
     • 如果反诉在某种程度上依赖本诉的证据或事实，但反诉本身仍然具有足够的独立性和完整性，法院也可能继续审理反诉，但可能会在审理过程中对相关证据和事实进行更为细致的审查。

三、反诉与本诉的案号使用

在本诉立案后，人民法院会给该案编制一个案号。由于反诉并没有经过独立的起诉程序，法院也没有对反诉单独编制案号，因此本诉与反诉通常会共用一个案号、案由，双方互为原、被告，在程序上互相牵连。在本诉撤诉后，人民法院应当以该案号作出撤诉裁定，而又因反诉没有独立的案号，这要求反诉的审理仍然继续使用本诉的案号并作出判决，不必另行更换案号。

四、实际案例与法律依据

• 实际案例：在最高法裁判的(2021)最高法民终815号案件中，法院认为本诉撤回后，反诉仍可在与本诉牵连相关范围内继续审理。这进一步证明了反诉的独立性及其在本诉撤回后的有效性。
• 法律依据：《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第二百三十三条规定：“反诉与本诉的诉讼请求基于相同法律关系、诉讼请求之间具有因果关系，或者反诉与本诉的诉讼请求基于相同事实的，人民法院应当合并审理。”这一规定为反诉在本诉撤回后的继续审理提供了法律依据。

总结与建议：

本诉按自动撤诉处理后，反诉仍然有效，且法院通常会继续审理。这是因为反诉具有独立性，其存在并不完全依赖于本诉。在实际操作中，如果本诉被撤回或按自动撤诉处理，反诉原告（即原诉中的被告）可以放心地继续参与反诉的审理，以维护自己的合法权益。如果您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。