不予起诉一般不会被记入个人人事档案，但在司法机关内部会留存相关记录。以下是对这一问题的详细分析：

一、不予起诉的定义与法律依据

不予起诉，又称相对不起诉，是指检察机关在审查案件后，认为犯罪嫌疑人的犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚，从而依法作出的不起诉决定。这一决定的法律依据主要来源于《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条第二款的相关规定。

二、司法机关内部的记录留存

1. 检察机关：在作出不予起诉决定后，检察机关会在其内部的相关档案中进行归档保存。这包括案件的整个诉讼过程，如侦查机关移送的材料、检察机关的审查材料及不起诉决定书等。这是为了保证司法工作的可追溯性和完整性，便于后续的统计、研究及必要时的查询。
2. 公安机关：公安机关也会在其系统中留存案件的相关信息，包括侦查情况及最终的处理结果（不予起诉）。这些记录主要用于司法机关的内部管理。

三、对个人人事档案的影响

1. 一般情况：不予起诉意味着行为人虽然实施了犯罪行为，但由于情节轻微等原因，最终没有被追究刑事责任。因此，在一般情况下，这种情况不会记入个人的人事档案，不会对行为人的工作、学习和生活产生重大的不利影响。
2. 就业方面：除了一些特殊行业（如公务员、司法人员等）在招录时可能会进行更为严格的审查外，大多数企业在招聘过程中通常不会因为行为人有过不予起诉的记录而拒绝录用。

四、未成年人的特殊保护

对于未成年人的不予起诉案件，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，犯罪时不满十八周岁且被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。这意味着，除非司法机关为办案需要或有关单位根据国家规定进行查询，否则不得向任何单位和个人提供这些记录。从保护未成年人的角度出发，司法实践中也会严格限制对这类记录的查询和使用。

五、建议与注意事项

1. 了解法律后果：虽然不予起诉一般不会记入个人人事档案，但司法机关内部会留存相关记录。因此，行为人应了解这一法律后果，并谨慎对待自己的行为。
2. 咨询专业律师：如果行为人对不予起诉的决定有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据具体情况提供专业的法律意见和建议。

如有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。我会尽我所能为你提供专业、全面的法律服务。