针对您提出的农产品合同订金纠纷处理流程问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：

农产品合同订金纠纷的处理，通常遵循以下步骤和原则：

一、友好协商

首先，合同双方应尝试在友好的基础上，通过相互协商来解决纠纷。这是最为直接且成本最低的方式。在协商过程中，双方可以就订金的退还、合同的继续履行或解除等关键问题进行讨论，并寻求达成共识。

二、要求调解

如果协商未能达成一致，合同双方可以要求有关机构进行调解。这些机构可能包括合同管理机关、仲裁机构或法庭等。调解过程中，调解员会听取双方的陈述和证据，并提出调解建议。如果双方接受调解建议，则可以签订调解协议，纠纷得以解决。

三、申请仲裁

若合同中明确规定了仲裁条款，或者双方在纠纷发生后达成了仲裁协议，那么合同当事人可以向仲裁机构申请仲裁。仲裁机构会依据相关法律法规和合同条款，对纠纷进行公正、独立的裁决。仲裁裁决具有法律效力，双方必须履行。

四、司法解决

如果合同中没有订立仲裁条款，事后也没有达成仲裁协议，那么合同当事人可以将合同纠纷起诉到法院，寻求司法解决。在诉讼过程中，法院会依法审理案件，并作出判决。判决具有强制执行力，如果一方不履行判决，另一方可以申请法院强制执行。

五、关于违约金的处理

在处理农产品合同订金纠纷时，还需要注意违约金的约定和处理。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金。如果约定的违约金低于造成的损失，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；如果约定的违约金过分高于造成的损失，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

综上所述，农产品合同订金纠纷的处理流程包括友好协商、要求调解、申请仲裁和司法解决等步骤。在处理过程中，双方应遵守相关法律法规和合同条款，尊重调解和仲裁结果，以维护自身的合法权益。希望这个解答能对您有所帮助。